1、海外、國內(院外)人員申請“百人計劃”
招聘崗位的確定
各招聘單位根據科技目標、學科建設及隊伍建設的實際需要，向院“百人計劃”辦公室(以下簡稱辦公室)提出2003—2005年度“百人計劃”招聘崗位申請。
辦公室匯總各單位的招聘崗位申請、提出復審原則，報主管領導批準後，分送各主管業務局復審和篩選。
各主管業務局復審內容主要包括：招聘崗位設置與研究所學科發展方向、創新項目、新設單元的結合情況；
辦公室匯總各業務局的復審結果，提交院“百人計劃”領導小組審議。
經領導小組審定，確定中國科學院2003—2005年度“百人計劃”招聘崗位，並向海內外公開發布。
招聘及申報方式
各單位對院批準的“百人計劃”招聘崗位，將更詳細的招聘信息以各種方式向海內外公開發布。
各單位自行組織招聘。從海外招聘的人員，必須具備《中國科學院關於引進海外傑出人才的管理辦法》中規定的引進海外傑出人才的基本條件；從國內(院外)招聘的人員，必須在原單位獲得研究員(教授)職位。
對已確定的錄用人員，需填寫《中國科學院“百人計劃”入選資格申請備案表》，由招聘單位報院辦公室。
院對申請者進行院級資格審查。院辦公室主要負責審查申請者的基本申報條件及人員和研究所經費到位情況；各業務局負責對申請者的學科專業與招聘崗位的壹致性進行復查，對通過院級資格審查的入選者，將向研究所寄發 《“百人計劃”入選通知書》。
院“百人計劃”辦公室每年將集中兩次以局發文形式，公布入選者名單。
院擇優支持的申請和評審
研究所對已到位工作六個月以上、發展勢頭良好並具有競爭力的入選者，可申請院擇優支持。由研究所填寫《中國科學院“百人計劃”擇優支持申請表》，報院辦公室；
院辦公室每年8月份受理申報材料；9至10月份由人教局匯同相關業務局對申請人的引進單位經費到位情況、科研進展、實驗室建設、隊伍組建等狀況進行實地考察；11月份召開院級專家評審會；各業務局根據專家意見、實地考察情況，提出復審意見，在院“百人計劃”領導小組會議上對人選進行介紹，由領導小組成員投票確定擇優支持人選。
對擇優支持的海外傑出人才和國內優秀人才，將以院發文形式公布受資助者名單，並給予相應的專項經費支持。
終期評估與後續支持
凡獲得“百人計劃”入選者榮譽稱號人員，實行崗位聘任年限制，聘期3年(自入選者名單公布的年度算起)。聘期結束後，均需參加院組織的終期評估。
院辦公室每年組織壹次終期評估。評估內容包括：綜合素質、工作進展、科研產出、人才培養及團隊建設、經費情況及實驗室建設。
院辦公室每年2月份布置終期評估工作，發布當年度參加終期評估入選者的名單。各招聘單位組織專家進行初評估。填寫《中國科學院“百人計劃”入選者終期考核評估表》。
主管業務局組織專家進行綜合評估。綜合評估程序包括入選者報告工作、專家提問、答辯、專家評議等，以評分方式評出結果和名次；並整理出被評議人的論文、論著、專利、成果、隊伍規模、對外爭取資源、獲獎、擔任各種職務、獲國家傑出青年基金等情況。
院辦公室匯總終期評估結果，提交領導小組審議。領導小組終審會議議程包括：辦公室主任匯報招聘單位初評估、業務局綜合評估的總體情況；各業務局的辦公室成員分別匯報綜合評估的具體情況(專家組成、評估程序、評估要點、評估具體結果)；領導小組討論審定終期評估結果。
院辦公室發文公布評估結果，按照規定對評估結果為優秀的入選者給予壹定的後續支持。
2、院內“國家傑出青年基金”獲得者申請
凡我院獲得“國家傑出青年基金”(以下簡稱“傑青”)資助的人員，在獲資助的當年或執行過程中，均可申請“百人計劃”。
申請“百人計劃”的院內“傑青”獲得者，需填寫《中國科學院國家傑出青年基金獲得者申請入選“百人計劃”備案表》，由招聘單位報院辦公室;
院辦公室對通過資格審查的人員，每年集中兩次以局發文形式，公布入選者名單。
入選者享受“百人計劃”入選者榮譽稱號，在基金項目執行完畢，經基金委考核通過後，填報《中國科學院國家傑出青年基金獲得者申請“百人計劃”擇優支持推薦表》與《國家傑出青年科學基金進展報告》及國家自然科學基金委員會經費資助的通知單壹並報院辦公室。
院將給予100萬元的專項經費支持。
獲“百人計劃”經費支持的院內“傑青”獲得者，按院“百人計劃”管理辦法管理。在受院資助結束後，需參加院組織的終期評估。對評估結果為優秀的入選者， 尤其是已形成良好團隊的優秀入選者給予壹定的後續支持。
3、海外學者申請“海外知名學者”
招聘崗位的確定
根據《中國科學院創新團隊組建和管理辦法(試行)》組建的創新團隊，可設立“海外知名學者”崗位，並在創新團隊組建的論證過程中，對其崗位的設立加以論證。隨著創新團隊的啟動，隨時向海外公布招聘指南。
招聘及申報方式
院根據已啟動創新團隊申報招聘人員情況，每年分兩至三次組織專家評審。
應聘者直接向招聘單位提出應聘申請，招聘單位對應聘人員組織專家組進行遴選、初審；將通過初審的候選人材料，通過網絡填報有關信息。
院辦公室將以網絡評審的方式，由我院“海外評審專家”對候選人進行通信評議。
各業務局根據專家意見，提出復審意見，在院“百人計劃”領導小組會議上對人選進行介紹，由領導小組成員投票確定人選。