近年來，鄭州大學承擔各級科研項目9000余項，其中國家級項目160余項，省(部)級重點項目400余項。700多項成果通過國家和省(部)級鑒定，589項成果獲得國家和省(部)級科研獎勵。申長雨教授主持的“橡塑制品模具設計中的關鍵力學問題及計算方法”和劉敏山教授、董教授主持的“新型高效縱列式殼程換熱器現代設計技術的研究與應用”等兩項成果獲國家科技進步二等獎，趙教授主持的“十二烷二酸合成尼龍1212的工業化生產研究”獲杜邦科技創新獎。2006年，鄭州大學獲得國家自然科學基金項目39項，國家社會科學基金項目16項，省級政府項目656項，科研經費金額達8500多萬元。2005年SCI收錄論文在全國高校排名第28位，EI收錄論文138篇。自2003年以來，學校申請了177項專利，其中包括95項發明專利。“乙醇汽油關鍵技術”、“生物柴油技術”、“橡膠模具技術”等壹批高新技術成果和關鍵技術實現產業化，有力促進了河南經濟發展和企業技術進步，進壹步提升了鄭州大學服務地方經濟建設和社會發展的能力。
鄭州大學學術氛圍活躍，對外交流廣泛，與美國、英國、法國、日本、俄羅斯、加拿大、澳大利亞、韓國、哈薩克斯坦、白俄羅斯、芬蘭、烏克蘭、香港、臺灣省等國家和地區的80所知名高校建立了校際合作關系。