知網和萬方收錄的論文的區別如下：
壹、創立時間不同
1、知網是由清華大學、清華同方發起，始建於1999年6月。
2、萬方數據庫《中國企業、公司及產品數據庫》始建於1988年。
二、定位不同
1、知網是以實現全社會知識資源傳播***享與增值利用為目標的信息化建設項目，采用自主開發並具有國際領先水平的數字圖書館技術，並正式啟動建設《中國知識資源總庫》及CNKI網格資源***享平臺。
2、萬方數據庫是由萬方數據公司開發的，涵蓋期刊、會議紀要、論文、學術成果、學術會議論文的大型網絡數據庫。
三、內容資源不同
1、中國知網服務內容包括：
（1）中國知識資源總庫：提供CNKI源數據庫、外文類、工業類、農業類、醫藥衛生類、經濟類和教育類多種數據庫。
（2）數字出版平臺：提供學科專業數字圖書館和行業圖書館。個性化服務平臺由個人數字圖書館、機構數字圖書館、數字化學習平臺等。
（3）文獻數據評價：主要統計內容包括；A、中國正式出版的7000多種自然科學、社會科學學術期刊發表的文獻量及其分類統計表；B、各期刊論文的引文量、引文鏈接量及其分類統計表：C、期刊論文作者發文量、被引量及其機構統計表；D、CNKI中心網站訪問量及分IP地址統計表。
（4）知識檢索：文獻搜索、數字搜索、翻譯助手、圖形搜索、專業主題、學術資源、學術統計分析。
3、萬方數據庫服務內容包括：
（1）成果專利：國內的科技成果、專利技術以及國家級科技計劃項目。
（2）中外標準：國家技術監督局、建設部情報所提供的中國國家標準、建設標準、建材標準、行業標準、國際標準、國際電工標準、歐洲標準以及美、英、德、法國國家標準和日本工業標準等。
（3）科技文獻：包括會議文獻、專業文獻、綜合文獻和英文文獻，涵蓋面廣，具有較高的權威性。
（4）機構：包括我國著名科研機構、高等院校、信息機構的信息。
（5）臺灣系列：內容為臺灣地區的科技、經濟、法規等相關信息。
（6）萬方學位論文：數據庫收錄我國各學科領域的學位論文。
知網工程的具體目標：
1、大規模集成整合知識信息資源，整體提高資源的綜合和增值利用價值；
2、建設知識資源互聯網傳播擴散與增值服務平臺，為全社會提供資源***享、數字化學習、知識創新信息化條件。
3、建設知識資源的深度開發利用平臺，為社會各方面提供知識管理與知識服務的信息化手段。
4、為知識資源生產出版部門創造互聯網出版發行的市場環境與商業機制，大力促進文化出版事業、產業的現代化建設與跨越式發展。