本病無有效的治療方法，加上患豬生產性能下降和高死亡率，使本病顯得尤為重要。而且因為PCV2的持續感染，使本病在經濟上具有更大的破壞性。抗生素的應用和良好的管理有助於解決並發感染的問題。
加強飼養管理
降低飼養密度、實行嚴格的全進全出制和混群制度、減少環境應激因素、控制並發感染、保證豬群具有穩定的免疫狀態、加強豬場內部和外部的生物安全措施、購豬時保證豬來自清潔的豬場是預防控制本病、降低經濟損失的有效措施。專利消毒劑Virkon S在1∶250稀釋消毒時能有效的殺滅圓環病毒，因此可將其應用於每批豬之間的終端消毒。
做好豬主要傳染病的免疫工作
PCV2與其相關豬病的發生還需要另外的條件或***同因素才得誘發臨床癥狀。世界各國控制本病的經驗是對***同感染源作適當的主動免疫和被動免疫，所以做好豬場豬瘟、豬偽狂犬病、豬細小病毒病、氣喘病和藍耳病等疫苗的免疫接種，確保胎兒和吮乳期仔豬的安全是關鍵。因此根據不同的可能病原和不同的疫苗對母豬實施合理的免疫程序至關重要。
人工被動免疫
可采取血清療法。從豬場的育肥豬采血（健康的淘汰種豬血最好），分離血清，給斷乳期的仔豬腹腔註射。
自家疫苗的使用
豬場壹旦發生本病，可把發病豬的內臟加工成自家疫苗，據臨床實踐，效果不錯。但現階段有兩種觀點：壹是母豬和斷奶仔豬同時免疫，優點是免疫效果快，基本在1～2月內能控制本病；缺點是如果滅活不徹底，將使本病長期存在。二是只免疫斷奶仔豬，優點是免疫安全性好，基本不會使本病長期存在；缺點是免疫效果慢，需要半年左右的時間才能控制本病。
“感染”物質的主動免疫
“感染”物質指本豬場感染豬的糞便、死產胎豬、木乃伊胎等，用來餵飼母豬，尤是初產母豬在配種前餵給，能得到較好的效果。如有壹定抗體的母豬在懷孕80天以後再作補充餵飼，則可產生較高免疫水平，並通過初乳傳遞給仔豬。這種方法，不僅對防制本病、保護胎豬和吮乳豬的健康有效，而且對其他腸道病毒引起的繁殖障礙也有較好的效果。但使用本法要十分慎重，如果場內有小豬會造成人工感染。
藥物預防
預防性投藥和治療，對控制細菌源性的混合感染或繼發感染，是非常可取的。但是至今PCV2引起相關豬病的病原和機制尚未完全了解，因此還不能完全依賴特異性防制措施，只能同時開展有效的綜合性措施，才能收到事半功倍的效果。
以下藥物預防方案可以試用：藍圓風暴配合刀豆素
仔豬用藥：哺乳仔豬在3、7、21日齡註射3次得米先（長效土黴素，200 mg/mL，每次0.5 mL），或者在1、7日齡和斷奶時各註射速解靈（頭孢噻呋，500 mg/mL)0.2 mL；斷奶前1周至斷奶後1個月，用支原凈（50 mg/kg)+金黴素或土黴素或強力黴素（150 mg/kg）拌料飼餵，同時用阿莫西林（500 mg/L）飲水。
母豬用藥：母豬在產前1周和產後1周，飼料中添加支原凈（100 mg/kg)+金黴素或土黴素（300 mg/kg）。
綜合防制計劃
分娩期：仔豬全進全出，兩批豬之間要清掃消毒；分娩前要清洗母豬和治療寄生蟲；限制交叉哺乳，如果確實需要也應限制在分娩後24小時以內。
斷乳期：豬圈小，原則上壹窩壹圈，豬圈分隔堅固；堅持嚴格的全進全出，並有與鄰舍分割的獨立糞尿排出系統；降低飼養密度：>0.33 m2/豬；增加餵料器空間：>7 cm/仔豬；改善空氣質量：NH3<10×10-6，CO2<0.1%，相對濕度<85%；豬舍溫度控制和調整：3周齡仔豬為28 ℃，每隔壹周調低2 ℃，直至常溫；批與批之間不混群。
生長育肥期：豬圈小，壁式分隔；堅持嚴格的全進全出、空欄、清洗和消毒制度；從斷奶後豬圈移出的豬不混群；整個育肥圈豬不再混群；降低飼養密度：>0.75 m2/豬；改善空氣質量和溫度。
其他：適宜的疫苗接種計劃；保育舍要有獨立的飲水加藥設施；嚴格的保健措施（斷尾、斷齒、註射時嚴格消毒）；將病豬及早移到治療室或撲殺。