專利費發票是專票，專利轉讓可以開增值稅票抵扣在全面施行營改增後，專利技術作為第三大類中銷售無形資產進行開票，其規定銷售轉讓專利技術和非專利技術，適用6%的增值稅稅率。
專票和普票的區別：
1、印制的要求不同
根據《稅收征管法》第二十二條規定：“增值稅發票由國務院稅務主管部門指定的企業印制；其他發票，按照國務院主管部門的規定，分別由省、自治區、直轄市國家稅務局、地方稅務局指定企業印制。
未經前款規定的稅務機關指定，不得印制發票。”依此可知，它們是由不同的印制單位印制的。
2、使用的主體不同
增值稅專用發票壹般只能由增值稅壹般納稅人領購使用，小規模納稅人需要使用的，須由稅務機關批準後由當地稅局代開。
不過到目前為止，國家已經將住宿業、鑒證咨詢業、建築業、工業及信息傳輸、軟件和信息技術服務業增值稅小規模納稅人納入了可自行開具增值稅專用發票的試點範圍，這7個行業的小規模納稅人除了銷售其取得的不動產的增值稅專用發票需要找稅局代開外，可以自行開具增值稅專用發票。
普通發票由從事經營活動並辦理了稅務登記的各種納稅人領購使用，甚至未辦理稅務登記的納稅人也可以向稅務機關申請領購普通發票，沒有特定的主體要求。
3、內容不同
普通發票開具的內容包括：購買單位、銷售單位、商品或服務名稱、商品或服務的數量和單位、單價和價款、開票單位（發票專用章）、收款人和開票日期等。
增值稅專用發票除了上述普通發票具備的內容外，還須有納稅人的稅務登記號（現在是統壹信用證號碼）、不含稅金額、稅率、稅額等內容，缺壹不可。
4、聯次不同
增值稅專用發票由基本聯次或者基本聯次附加其他聯次構成，基本聯次由記賬聯、抵扣聯和發票聯組成，現在我國的增值稅專用發票壹般為三聯和六聯兩種。
普通發票壹般也由基本聯次或者基本聯次附加其他聯次構成，基本聯次為兩聯：記賬聯、發票聯，我國現行普通發票壹般分為兩聯和五聯兩種。
5、作用不同
增值稅專用發票不僅只是購銷雙方的收付款憑證，還可以用作購買方抵扣增值稅的憑據。普通發票中，運費、收購農副產品、廢舊物資的可以按法定稅率抵扣，稅控設備和維護費可全額抵扣，其他的壹律不可以抵扣。