版權和專利是兩種不同形式的知識產權。專利和軟件著作權都是知識產權的壹種形式，但兩者有很大的不同，但人們往往把專利和軟件著作權看成是壹種形式。
主要區別如下:
1，根據不同的規律。
軟件版權保護的依據是《著作權法》和《計算機軟件保護條例》。
軟件的專利保護是基於專利法。具體審查標準參見《國家知識產權局專利審查指南》第二部分第九章“關於審查涉及計算機程序的發明專利申請的若幹問題”。
2.保護原則不同。
軟件著作權是在軟件創作完成後自動產生的，也是軟件著作權的自願登記。登記的目的是體現公證的效力，主要用於宣示著作權的歸屬，同時也是為了後續維權的證據更強。
軟件專利必須向專利局申請才能獲得保護，所以必須積極申請，專利制度是以“公開換保護”為原則的。
3.不同的保護對象
軟件著作權申請提交的材料是源代碼和用戶操作手冊，所以軟件著作權保護的是表達，而不是想法。
這樣競爭對手就有可能研究軟件，然後改變編程語言，結果是壹樣的，但是因為代碼不壹樣，不侵犯版權。
而軟件專利則是在申請時描述軟件的設計思路(註意壹定要用技術方案的形式表達，或者最好和硬件結合)，包括軟件流程圖的內容，而不是主要說明用哪種編程語言來實現。壹旦授權，他人只要采用軟件專利的設計思想或方案，都可能構成侵權。
4.申請通過率不壹樣
軟件著作權是登記制，壹般不需要實質審查。只要形式審查時提交的材料符合要求，不違反著作權法的規定，就可以授予軟件著作權，登記通過率極高。
軟件專利需要形式審查和實際審查。
形式審查主要是審查專利材料是否符合申請要求。形式審查通過後會公之於眾，然後進入實質審查，審查專利是否符合專利法的要求，必須滿足新穎性、創造性、實用性等諸多要求。
5、保護期和維護費用不同。
對於公民的作品，法律規定的相關著作權保護期為作者生前加死後50年；對於法人和其他組織的作品，法律規定的相關著作權保護期為50年。
費用方面，只交初始申請費，以後不收維護費。
壹般來說，軟件專利只能申請發明專利，保護期限為自申請日起20年。
發明專利每年需要繳納年費，到期後不繳納視為放棄專利權。
6.不同的優點和缺點
軟件版權可以不公開保護，創作者可以很快得到版權保護。壹般授權壹般需要4個月左右，加急申請軟件著作權最快壹個工作日即可授權。可以讓版權人快速搶占市場，獲得相應的政府資助。
法律依據
《中華人民共和國物權法》第十條
專利申請權和專利權可以轉讓。
中國的單位或者個人向外國人、外國企業或者外國其他組織轉讓專利申請權或者專利權的，應當依照有關法律、行政法規的規定辦理手續。
轉讓專利申請權或者專利權的，當事人應當訂立書面合同，並向國務院專利行政部門登記，由國務院專利行政部門予以公告。專利申請權或者專利權的轉讓自登記之日起生效。