1．本指南包括前言、使用說明、略語表、目錄、正文、索引、修訂說明和附錄 。
2．本指南正文***分五個部分：第壹部分（初步審查）、第二部分（實質審查）、第三部分（進入國家階段的國際申請的審查）、第四部分（復審與無效請求的審查）和第五部分（專利申請及事務處理）。第壹、二、四部分按專利申請的審批流程順序排列，第三部分為進入國家階段的國際申請審查的具體規定，第五部分為適用各程序的通用規則。
3．本指南各個部分中分章，章以下設節，節分四個等級，用阿拉伯數字按順序排列以確定其位置。例如，本指南第二部分第三章（新穎性）中，2．1．2．2（使用公開）是第四級節，它屬於第三級節2．1．2（公開方式），2．1．2節屬於第二級節2．1（現有技術），2．1節屬於第壹級節2（新穎性的概念）。
4．本指南的目錄包括總目錄和分目錄。總目錄列出第壹至第五部分中各章的名稱及其對應的頁碼；分目錄列出該部分各章、節（***四個等級節）的名稱及其對應的頁碼。讀者可以根據需要查找的內容，在總目錄中找到該內容屬於第幾部分第幾章，再到相應的分目錄中找到其具體位置。
5．本指南除使用總頁碼外還使用了分頁碼，以便讀者查閱。總頁碼位於頁面底端外側，對全書進行連續編頁；分頁碼位於頁面底端中央，對指南正文的五個部分分別編頁並采用“（×－×）”的格式，例如“（2－147）”表示本指南正文第二部分第147頁。
6．本指南正文包括文字描述及法律、法規條款標引兩欄，前者位於每頁的右側，後者位於每頁的左側。法律、法規條款標引使用縮略語（參見略語表）。讀者閱讀指南右欄的內容時，可以對照左欄相應位置上標出的法律、法規條款中規定的內容，以幫助理解。