1，種養結合
這是目前我國畜禽糞便處理的主要方式。農場使用幹洗或泡沫糞收集糞便。在幹糞清理的情況下，固體糞便通過堆肥或其他無害化方式處理，汙水和部分固體糞便通過厭氧發酵和氧化塘處理。在養分管理的基礎上，對大田作物、蔬菜、果樹、茶園和樹木施用有機肥、沼渣、沼液或肥水。在氣泡糞肥的情況下，糞肥經過厭氧發酵和氧化塘處理，然後還田用於農業生產。
2.回收利用
廣泛應用於奶牛場和養鴨場。養殖場主要采用幹法清糞的方式，就是通過控制生產用水來減少養殖過程中的用水量，並在田間實行汙水暗渠輸送、雨汙分流、固液分離，減輕汙水處理壓力。處理過的汙水可以用來清洗田裏的糞坑和柵欄。固體肥料可以通過堆肥、基質生產、牛床墊材料、燃料和其他方式進行處理和利用。
3.達標排放
目前這種處理方式的比例比較小。原因之壹是糞汙處理設備成本高，給養殖場造成很大壓力；第二，糞便本身是壹種可重復利用的資源。要達到排放標準，要求汙水經過厭氧和好氧工藝處理後，出水水質達到國家排放標準，固體糞便經過堆肥處理後再利用。
4.集中式處理
在人口密集地區，依托大型養殖場或專門的糞便處理中心，將周邊養殖場(小區、規模養殖戶)的糞便或汙水集中收集處理。
二、畜禽糞便的資源化利用
對比各種畜禽糞便資源化利用處置方案，我們采用了可組合的模塊化單元設計，既能就地處置大型養殖場的固體糞便，又能處置大型集中處理站的固體糞便，產出物為有機肥原料。液體肥料采用三級沈澱好氧發酵罐，輸出為液體有機肥。
1，固體糞便
目前養殖場基本采用還田、堆肥的方式。但也存在占地面積大、處理周期長、無害化不徹底、易產生二次汙染等問題。SJC好氧發酵工藝系統包括自動攪拌倉、發酵箱和除臭裝置。混合倉將固體肥料、輔料和菌群有效調節混合到壹個封閉的發酵箱中，發酵箱通過內部單元的聯動輸出富含有機質的產品。生成的有機產品清潔穩定，可以放心直接作為有機肥原料施用或儲存。除臭裝置回收廢氣，確保處理過程的無害化。
流程特征:
實踐證明，該工藝是固體廢棄物的最佳處置方案。唯壹能保證不產生臭氣和垃圾滲濾液的工藝是工程設備。采用自動翻料鬥設計，占地面積小，處理效率高，單體處理量大，維護運行費用低。
這些裝置是模塊化的，可以單獨使用或組合使用，以滿足不同規模的處理要求。與常見的攪拌式相比，如鼓式、罐式、筒倉式等。單體處理量大，維護和運行費用低。與同規模各種堆肥工藝相比，占地面積減少50-75%，適合大型養殖場的現場處置和大規模集中處置。
2.糞液
采用三級循環好氧發酵沈澱池，采用攪拌+曝氣+菌群的方案。7-15天即可加工成富含有益微生物的無味液體生物菌肥，設施成本低，操作簡單，資源利用迅速。