1、兩者法律依據不壹樣
軟件的著作權保護依據是《著作權法》和《計算機軟件保護條例》。而軟件的專利保護依據《專利法》，有關具體的審查標準需參照國家知識產權局專利《審查指南》第2部分第九章“涉及到計算機程序的發明專利申請審查若幹個問題”。
2、保護期限和維修費用不壹樣
軟件著作權白保護期為創作者終生及死亡後50年，截至於創作者死亡後50年的12月31日;
如果是合作作品，截至於最後死亡的創作者死亡後第50年的12月31日;
法人以及其他組織的作品，其法律規定的有關著作權的保護期為50年。
費用這方面只會繳納早期的申請費用，後面不會有維護的費用。
壹般來講，軟件專利是申請發明專利，保護期限從申請日起算二十年。
而發明專利每壹年都需要繳納年費，倘若過期不繳納就被視作選擇放棄專利權。
3、兩者保護基本原則不壹樣
軟件著作權是在軟件創作完成後自動產生的，也是自願進行軟件著作權登記，登記的目的是體現公證的效力，主要是用以聲明著作權所有權，後面維權時的證據力度更大，是手機軟件上架的必備品，倘若申請高企還可享有最高30%稅收減免和最高200萬的國家補貼。
軟件專利則必須向國家專利局提交申請才可以得到保護，因而必須要積極申請，且專利制度也是以“用公開換保護”為基本原則。
4、申請成功率不壹樣
軟件著作權推行的是登記制，只需要形式審查時遞交的材料符合規定，而且不違背《著作權法》的規定就可以獲權，登記成功率很高
軟件專利需要通過形式審查和實際審查。通常純軟件型的專利不容易獲權，通過軟硬件相結合的形式會提升其授權率，但總體來說成功率要相對性低壹點。
5、下證周期時間不壹樣
軟件著作權能夠無需公開就受到保護，而且能夠讓創作者更快地得到著作權保護，選用加急申請軟件著作權6-12個工作日就能夠 獲得證書，而且是不成功全額退款的。那樣的時效性可以幫助著作權人迅速占領市場，獲得政府相對應的資助。
專利權還有軟件的著作權存在很多方面的不同，軟件著作權推行的是登記制，軟件型的專利不容易獲權，軟件著作權是在軟件創作完成後自動產生的，發明專利每壹年都需要繳納年費，軟件著作權白保護期為創作者終生及死亡後50年。
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