輔酶Q10在人體主要有兩個作用，壹是在營養物質在線粒體內轉化為能量的過程中起重要的作用；二是有明顯的抗脂質過氧化作用。
1.輔酶Q10是人體細胞能量加工廠的重要成員
細胞若要正常工作，就必須要有源源不斷的能量。人體通過飲食攝取大米，肉類，蔬菜等就可獲得糖、氨基酸和脂肪等能提供能量的營養成分，然後，這些營養成分通過體內各種轉運途徑，進入細胞，在細胞中被稱為能量加工廠的線粒體中轉化，變成了可供人體細胞利用的物質成分：ATP（三磷酸腺苷），而細胞這個能源加工廠在制造ATP時，有壹個重要的緩解就必須要有輔酶Q10的參與，如果沒有輔酶Q10，細胞就無法產生能量。
2.輔酶Q10是體內自由基清除劑
正常情況下，人體內的自由基是處於動態平衡的，但若是體內自由基產生過多或消除過慢，自由基就會在分子水平、細胞水平及器官水平產生毒害作用，損傷細胞成分、破壞細胞的結構和功能，給機體造成損傷，這個過程稱之為氧化應激作用，這些損害可以引起慢性疾病，也是導致人體衰老的主要原因。
而輔酶Q10能阻止脂和蛋白質的過氧化，清楚自由基，降低線粒體氧耗，減少細胞三磷酸腺苷消耗，維持細胞線粒體結構的完整性，防止細胞水腫，細胞膜破裂，以及線粒體溶解與肌纖維的紊亂性排列，輔酶Q10還能通過氧化還原型結構的變換，加強細胞內膜抵抗外界氧化因子的損害，是人體內唯壹的壹種天然存在的、又能在人體中再生的脂溶性抗氧化劑。
3.輔酶Q10是體內具有重要作用的輔酶
輔酶Q10是體內具有重要作用的輔酶，是生物細胞呼吸鏈中的重要遞氫體， 參與氧化磷酸化及ATP的生成過程，調控細胞氧化還原環境。在呼吸鏈中輔酶Q10 是壹個和蛋白質結合不緊密的輔酶，使它在黃素蛋白類和細胞色素之間能作為壹種特殊靈活的載體而起作用；另外，其醌環中苯醌的羥基取代基使它傾向於極性，而結構中的聚異戊二烯側鏈使它在疏水性環境中具有較低的自由能，能在線粒體內膜中迅速擴散。輔酶Q10從復合體I和復合體II接受氫，將質子釋放至線粒體基質內，電子傳遞給細胞色素，通過這壹過程促進氧化磷酸化及電子的主動轉移，由此形成機體能量儲存的主要物質ATP。
4.輔酶Q10是心臟的保護神
輔酶Q10在心肌中含量最高，是心肌細胞能量的催化劑，人的心臟每日跳動11.5萬次，而輔酶Q1則是這部發動機的加油站，它能促進心肌細胞線粒體能量的制造和心肌細胞的新陳代謝增加，確保心肌能量源源不斷，為心肌提供持久的動力支持。
現已經證明，幾乎所有心臟病患者及某些非心血管疾病患者，其組織中均有內源性輔酶Q10缺乏，而給予外源性輔酶Q10可使患者臨床癥狀明顯改善。有報道稱超過75%的心臟病患者在服用輔酶Q10後，病情顯著改善。輔酶Q10能夠激活細胞呼吸，可以為心肌細胞和腦細胞提供充充足的氧氣和能量，使細胞保持良好健康的狀態，因此能預防心腦血管事件發生。
5.輔酶Q10是神經細胞的保衛者
輔酶Q10是線粒體呼吸鏈重要組分之壹。輔酶Q10作為線粒體內解偶聯蛋白和多種脫氫酶的輔因子，是細胞外誘導神經酰胺依賴性雕亡通路的調節因子，神經酰胺主要產生於神經鞘磷脂循環通路，是細胞雕亡中常見的第二信使分子，缺乏輔酶Q10，神經元就會加速雕亡。輔酶Q10還是細胞內有效的抗氧化劑和自由基清除劑，能夠對抗低密度脂蛋白的氧化，因此，輔酶Qo是保護神經元的重要成分。
6.輔酶Q10的保肝護肝解毒作用
輔酶Q10在肝臟中的含量也比較高，對肝也有很好的保護作用。由於肝內的壹切生物化學反應都需要肝細胞內各種酶系統參加，輔酶Q10也是參與肝臟解毒的重要成員之壹。肝損傷多數都是線粒體受損，輔酶Q10減少或缺失引起的，壹些他汀類藥物對肝的損傷可以導致肝臟輔酶Q10減少，在臨床觀察中，在應用這些藥物治療疾病時，，補充壹定量的輔酶Q10可以減輕這些藥物帶來的不良反應，同時對這些藥物的療效沒有明顯的不良影響。