1985年，考入東北師範大學化學系，1992年獲得有機合成專業碩士。在東北師大的7年學習，為日後的科研工作打下了良好的基礎。有壹次實驗中的失誤，使她手臂大面積二度燒傷。
1992年畢業後，到哈爾濱醫藥集團技術中心工作。剛來技術中心不久，就負責了甜味素產品的技術攻關，經過近兩年的努力終獲成功。這7年，主要做新藥的研發，與基礎理論研究不同的是，獲得了在學校學不到的很多產業化研發經驗。
出於對新知識的渴望，付玉傑1999年考入東北林業大學國家重點學科植物學進行博士學位的學習，師從祖元剛教授。
可以說，東北林大的7年是她在科學道路上的快速成長期，她的研究取得了突飛猛進的進展。森林植物生態學實驗室是教育部重點實驗室，在本學科有大量成果積累，有壹個很好的研究平臺，特別是導師祖元剛教授，為她的成長做出艱辛付出，使在原有的產業化經驗基礎上、在導師的帶領下，與團隊中的同事們獲得了壹項又壹項科研成果。
付玉傑說，在實驗室外對植物資源進行野外實習、考察、采樣，經常是風吹日曬、蚊蟲叮咬；實驗室內，無數次的實驗測試經常是通宵達旦。在森林植物資源生態利用方面，收獲了壹項又壹項的科研成果，先後獲得國家技術發明二等獎1項、省部級獎勵多項、國家發明專利11項。
付玉傑主要從事植物活性成分代謝基礎理論和應用研究，把植物細胞團塊多級脅迫誘導生物半合成技術、強化傳質高效提取活性成分和酶解酸解助提取活性成分等多項擁有自主知識產權的技術應用到產業化開發項目中，產生了可觀的經濟效益，對我國植物資源培育和利用、林業資源產業結構優化升級和實現林業行業技術跨越發展起到了促進作用，對我國資源可持續發展和利用具有重要的示範性。
其中在甘草應用基礎研究和產業化開發技術中，“甘草多種有效成分高效提取和純化產業化生產新工藝”2005年獲教育部提名國家科學技術獎二等獎。與哈爾濱夏天甘草研究所合作，在大慶建立了第壹個北方烏拉爾甘草標準化種植基地，2004年底累計已實現產值933萬元，帶動了當地農民的種植，增加了農民的收入。“喜樹堿衍生物高效提取技術研究”建立起壹整套以生物轉化法獲得的以喜樹種芽為生產原料，應用鮮法勻漿和快速滲濾法、負壓空化混旋固液萃取法等創新性技術高效生產天然高純度HCPT和CPT的產業化生產工藝，該研究於2004年獲得國家科技進步二等獎。
“我個性比較直率、倔強，喜歡刨根問底。喜歡做就做好，做踏實。我不相信有天才，所以勤奮是成功最好的手段。”“我喜歡搞科研、做老師，因為比較踏實、坦然，沒有生意場上的那種起起落落，能很好地實現自我價值和社會價值的統壹。”事業成功的付玉傑，無形中漸漸被家人和同事樹立為教育孩子的榜樣。
在獲得第九屆中國青年科技獎和第八屆黑龍江省青年五四獎章，國家科技進步二等獎壹項，教育部提名國家科技獎兩項後，付玉傑又獲得了第三屆中國青年女科學家獎。“這次獲得這項殊榮，我感覺自己肩上的任務更重了、壓力更大了，我會把壓力變為無窮的動力，在森林植物資源活性成分的篩選、分離和林業生物制劑方面不停地探索，更好地回報培育我的導師、學校和社會。”