法律分析：1.專利權所屬個人申請專利權歸個人所有，與公司無關，但是職務發明由個人申請容易產生專利權屬糾紛。公司申請專利權歸公司所有，無權屬糾紛，在高新技術企業認定、公司上市做價方面比較易操作。
2.費用個人申請如果經濟困難的話可以享受減免，減緩前三年所交年費，只要交15% 。公司申請的話費用較貴，在部分地區可享受政府補貼、利於評優、申報高新技術企業、進行專利質押等等。
3.宣傳個人申請的話不利於品牌宣傳。公司申請有利於企業品牌宣傳，利於後期融資。
4.難度個人和公司申請的審查過程、申請時限 、申請難易度是沒有差別的。申請從費用上看，似乎個人申請更好壹些，但如果針對企業，從長遠上看還是以公司名義申請更好。
法律依據：《中華人民***和國專利法》
第六條 執行本單位的任務或者主要是利用本單位的物質技術條件所完成的發明創造為職務發明創造。職務發明創造申請專利的權利屬於該單位，申請被批準後，該單位為專利權人。該單位可以依法處置其職務發明創造申請專利的權利和專利權，促進相關發明創造的實施和運用。
非職務發明創造，申請專利的權利屬於發明人或者設計人；申請被批準後，該發明人或者設計人為專利權人。
利用本單位的物質技術條件所完成的發明創造，單位與發明人或者設計人訂有合同，對申請專利的權利和專利權的歸屬作出約定的，從其約定。
第七條 對發明人或者設計人的非職務發明創造專利申請，任何單位或者個人不得壓制。
第八條 兩個以上單位或者個人合作完成的發明創造、壹個單位或者個人接受其他單位或者個人委托所完成的發明創造，除另有協議的以外，申請專利的權利屬於完成或者***同完成的單位或者個人；申請被批準後，申請的單位或者個人為專利權人。
第九條 同樣的發明創造只能授予壹項專利權。但是，同壹申請人同日對同樣的發明創造既申請實用新型專利又申請發明專利，先獲得的實用新型專利權尚未終止，且申請人聲明放棄該實用新型專利權的，可以授予發明專利權。
兩個以上的申請人分別就同樣的發明創造申請專利的，專利權授予最先申請的人。
第十條 專利申請權和專利權可以轉讓。中國單位或者個人向外國人、外國企業或者外國其他組織轉讓專利申請權或者專利權的，應當依照有關法律、行政法規的規定辦理手續。
轉讓專利申請權或者專利權的，當事人應當訂立書面合同，並向國務院專利行政部門登記，由國務院專利行政部門予以公告。專利申請權或者專利權的轉讓自登記之日起生效。
第十壹條 發明和實用新型專利權被授予後，除本法另有規定的以外，任何單位或者個人未經專利權人許可，都不得實施其專利，即不得為生產經營目的制造、使用、許諾銷售、銷售、進口其專利產品，或者使用其專利方法以及使用、許諾銷售、銷售、進口依照該專利方法直接獲得的產品。
外觀設計專利權被授予後，任何單位或者個人未經專利權人許可，都不得實施其專利，即不得為生產經營目的制造、許諾銷售、銷售、進口其外觀設計專利產品。