港珠澳大橋是名副其實的科技橋。在這些世界級挑戰的背後，是壹系列創新和科技支撐的強大驅動。自2003年開始籌備工作以來，200多家科研單位、數千名科技工作者圍繞港珠澳大橋建設，以國家科技支撐計劃研究為主線，開展了300多個科研項目。
從前期項目的可行性研究階段到開工建設，科技創新的理念貫穿始終。這個超級工程聚集了橋梁設計施工、材料研發、工程裝備乃至生態環保等領域的數千名科技工作者，開展了300多項科研項目，獲得了100多項發明專利，發表了500多篇論文，創造了40多種施工方法。
國家科技支撐計劃自2010開始啟動“港珠澳大橋跨海集群工程建設關鍵技術研究與示範”項目，涉及橋梁建設的各種難點。以專業、創新、實用的科技攻關支撐了港珠澳大橋建設，啃下了硬骨頭，在關鍵技術、關鍵設備、關鍵材料等方面取得了全面突破，也為我國交通建設行業的自主創新和技術進步發揮了引領作用。
港珠澳大橋島隧工程是世界上深埋沈管首例，也是沈管隧道首次無滲漏。
港珠澳大橋島隧工程是世界上第壹條深埋沈管隧道。傳統沈管隧道都是淺埋，但港珠澳大橋沈管頂部的荷載是傳統沈管的5倍。如果根據國外經驗采用分段式管接頭(柔性)，可能存在接頭阻力不足、接頭泄漏等風險。技術人員最終從理論上揭示了深埋沈管結構體系的受力和變形機理，創新性地提出了壹種新的半剛性沈管結構。與國外專家提出的“深埋淺做”方案相比，該方案節省了工期。
作為世界上最大的鋼結構橋梁，該橋主梁的鋼板消耗量高達42萬噸。這相當於10個鳥巢或60個埃菲爾鐵塔的重量，可抗16級臺風和7級地震。大橋鋼橋面鋪裝面積達到50萬平方米，也創下了世界紀錄。
更神奇的是，這座橋全是由“積木”搭建而成。港珠澳大橋的所有構件，無論大小，包括重達數千噸的橋墩、橋體和高度超過100米的橋塔，都是在陸上工廠整體制造，然後運到海上，像搭積木壹樣組裝在壹起，實現了精準制造、精準安裝。
港珠澳大橋也是綠色工程。建設之初，最擔心的白海豚只有1400；主體工程完成後，白海豚數量增加到1800只。