繼承了哈工大強大的工科特色，深圳校區工理結合，壹些重點研究領域始終保持與國際學術前沿同步，包括：納米器件設計、深空通信、高速光通信關鍵技術、航天技術、超高速超高清圖像感知技術、先進電子制造、集成納米科學與技術、納米與新能源材料、微納米智能生物材料、無機聚合膠凝材料、水汙染控制及創新性廢水處理、城市規劃模擬仿真平臺等。近年來，深圳校區科研經費持續快速增長，校企合作不斷深入，已成為華南地區獨具特色的學術與科研基地之壹。
科研經費逐年持續快速增長，2015年科研合同經費達1.57億，歷年累計經費已超過9億；科研規模不斷擴大、質量不斷提高，基礎研究與技術創新項目逐漸形成優勢，自然科學基金項目成為發展特色，2015年獲得國家自然科學基金傑出青年科學基金、重點項目各1項。論文數量穩步提升，質量實現跨越式增長，2015年度SCI收錄論文368篇，EI收錄論文576篇，CPCI-S收錄論文50篇；專利申請量及授權數持續增長，2015年申請專利143項，授權專利50項，為地方經濟、社會轉型與發展起到重要支撐作用；截至2015年底，***獲得國家級獎項4項，省/部級獎項22項，市級及其他級別獎項26項。
通過與企業合作，在學科建設不斷適應國家經濟建設需要和社會需求的同時，充分發揮出了高校的科研實力，為企業提供最新的科技信息和科研成果，促進了高校科研成果商品化和產業化，協助企業解決生產過程中的技術與管理問題，增強企業的技術創新和市場競爭力。目前累計與深圳500余家企業開展了實質性合作，為企業解決1000余個關鍵技術問題，項目經費達到近3億元。
與微軟、騰訊、施耐德、中興通訊等知名公司***建近30個校企聯合實驗室，授牌西門子、華為、大族激光、美的等近60家企業為校企合作產學研基地。通過校企聯合培養的碩士研究生約占研究生總數的四分之壹，畢業後得到了學校、學生、企業、社會的高度評價。
創新載體培育成效顯著，目前已建設31個創新研究中心，深圳市、區二級科研平臺31個，其中深圳市重點實驗室13個（3個以國家重點實驗室標準籌建），深圳市工程實驗室9個，深圳市公***服務平臺6個，南山區創新機構3個，並與香港大學、航天科工、微軟等國際著名大學、研究機構和國際級企業合作建立了近30所聯合實驗室。國際著名大學、研究機構和國際級企業合作建立了近30所聯合實驗室。 智能計算研究中心
計算機應用研究中心
網絡計算研究中心
生物計算研究中心
先進設計與制造技術研究中心
光機電壹體化技術研究中心
電力電子與電力傳動研究中心
風力發電與自動化研究中心
流固聲耦合及控制研究中心
橋梁與結構工程研究中心
城市與土木工程防災減災研究中心
結構與巖土工程研究中心
環境科學與工程研究中心
管理工程與資本市場研究中心
城市與景觀設計研究中心
工商管理與服務創新研究中心
先進功能材料與器件研究中心
微電子封裝材料與技術研究中心
工程力學研究中心
應用數學研究中心
北美研究中心
創新信息產業研究中心
通信工程研究中心
微電子技術研究中心