在科學研究方面，電氣與自動化工程學院發揮多學科交叉和相互滲透的綜合優勢，堅持基礎研究與成果轉化並重，產、學、研緊密結合的發展思路，形成了基礎研究的高水平和科研成果的高轉化率的明顯特色。依托國家重點學科建設的高等學校可再生能源並網發電創新引智基地和教育部光伏系統工程中心，多年來壹直以太陽能的光伏利用、風力發電、基於可再生能源的分布式發電技術、柔性輸配電技術、特種電源、新型電氣傳動和運動控制為主要研究方向，在太陽能和風能並網發電技術、基於可再生能源的分布式發電技術、高低壓變流與特種電源技術、特種永磁電機設計、新型電力傳動、等離子體的電磁場約束技術、電能質量控制等方面已經形成明顯優勢和特色；依托我院的教育部IC網上設計中心重點研究控制系統的嵌入式集成化設計方法和實用芯片設計，在SOC和IP兩個研究方向上均有突出建樹，獲得了卓有成效的研發成果並實現了產業化，產品在軍用和民用領域獲得廣泛應用；安徽省工業自動化工程研究中心在運動控制系統與過程控制系統、計算機控制系統與控制網絡、嵌入式系統與測控網絡、自動檢測與信號處理技術、智能化監測與先進控制系統、自動化儀表與裝置等領域都取得了顯著的成績，科研成果廣泛應用於電力、冶金、礦山、交通、石化、煙草、食品等領域。自2003年以來，學院教師***承擔科研項目584項，其中國家和省部級項目63項，含國家自然科學基金項目7項；國家“863”高科技項目5項；其他重點科技攻關項目16項；獲安徽省科學技術壹等獎1項，二等獎4項，三等獎3項。幾年來，完成科研縱向項目合同經費1500萬元；積極與企業合作，承擔了大批應用開發型項目，橫向項目合同經費約4600萬元；發表學術論文800余篇，被EI/SCI收錄170余篇；出版專著5部，教材22本；獲發明專利8項。