目錄構成
(壹)《藥品目錄》中的藥品分為西藥、中成藥和中藥飲片三部分。其中，1027和1031種西藥、823種中成藥和47種民族藥分別允許基本醫療保險和工傷保險基金支付。醫療保險和工傷保險基金不予支付的中藥飲片有127種和1類，其中99種不予單方支付，28種不予單方支付，1類不予單方支付。
(二)基本醫療保險藥品分為甲類和乙類..西藥甲類品種315，乙類品種712。中成藥135個品種，中成藥688個品種。工傷保險藥品不分為甲類和乙類..
二、排列和分類
(3)西藥、中成藥、民族藥按藥品品種編號，不同劑型的同壹品種只有壹個編號，重復出現時用“，”標註，品種號用括號標註。藥品編號的順序沒有特殊含義。
(4)西藥主要按臨床藥理和臨床科室用藥分類，中成藥主要按臨床科室用藥和功能主治分類。臨床科室醫生根據病情用藥，不受藥品目錄中分類的限制。
(5)西藥名稱除備註欄中標註“▽”的藥品外，均采用中文通用名稱和英文國際通用藥品名稱(INN)中表示化學成分的部分，不包括名稱中的鹽基和酸根部分，劑型單獨列出。
中成藥名稱采用藥品標準中的正式名稱。為了使排列簡單，正式名稱相同但劑型不同的藥物並列在同壹分類和給藥途徑下。如藿香正氣丸、藿香正氣顆粒、藿香正氣膠囊、藿香正氣片、藿香正氣滴丸、藿香正氣口服液，表述為藿香正氣丸(顆粒、膠囊、膠囊)。
標簽劑型
包括的劑型
口服正常釋放劑型
普通片劑(片劑、腸溶片、包衣片、薄膜衣片、糖衣片、浸膏片、分散片和刮片)、硬膠囊、軟膠囊(膠囊)和腸溶膠囊。
緩釋控釋劑型
緩釋片劑、緩釋包衣片、控釋片、緩釋膠囊和控釋膠囊
口服液體制劑
口服溶液劑、口服混懸劑、口服乳劑、膠漿劑、口服液、乳劑、乳劑、膠體溶液、合劑、酊劑和混懸滴劑。
藥丸
藥丸，滴丸
顆粒狀農藥
顆粒，腸溶顆粒
口服粉劑
粉末，粉末，粉末
外部粉末
粉末，粉末，擴散劑，噴粉
藥膏
軟膏，乳膏，乳膏，糊劑，軟膏
修補
貼劑，貼劑，薄膜，透皮貼劑
外用液體
外用溶液、洗液、漱口水、漱口液、粘液、搽劑、酊劑和油。
石膏
石膏、親水石膏
凝膠
乳膠和凝膠
塗劑
塗層劑，薄膜塗層劑，塗層劑
栓劑
栓劑、肛門栓劑、陰道栓劑
滴眼劑
滴眼劑
滴耳劑
滴耳劑
滴鼻劑
滴鼻劑
吸入器
噴霧劑，氣霧劑，鼻噴霧劑，粉末噴霧劑，氣霧劑吸入，氣霧劑混懸液，氣霧劑溶液，氣霧劑吸入，吸入粉末，幹粉，幹粉吸入，粉末吸入，幹粉吸入，吸入溶液，吸入混懸液。
註射
註射劑、註射劑、註射用溶液、靜脈滴註用註射劑、註射用混懸劑、註射用無菌粉末、靜脈註射、水針劑、註射用乳劑、粉針劑、註射劑、無菌粉末註射液和凍幹粉針劑。
(7)凡在《藥品目錄》中註明劑型為“註射劑”的藥品，不包括含溶劑量大於100ML的非溶劑藥品的靜脈輸註劑型。如阿奇黴素註射液不包括容量大於100ML的阿奇黴素葡萄糖註射液、阿奇黴素氯化鈉註射液等含藥輸液劑型。
除了緊急搶救和特殊適應癥的藥物，各個領域都有規定。
(八)名稱和劑型的說明:
1.通用名中的主要化學成分與藥品目錄中的化學成分相同，但商品名或規格不同的西藥屬於藥品目錄。
2.通用名中的主要化學成分與藥品目錄中的相同，劑型也相同，而不同酸根或不同堿基的西藥則屬於藥品目錄。
3.正式名稱中劑型前部分與藥品目錄中劑型前部分壹致，劑型相同，而商品名或規格不同的中成藥則屬於藥品目錄。
(9)備註欄中標註“▽”的藥品因其成分和適應癥相似而分類，標註的名稱為第壹類藥品的通用名。詳情如下:
1.西醫零件號171“動物骨多肽註射液”包括骨肽註射液和鹿瓜多肽註射液。
2.西醫零件號178“緩解感冒癥狀的復方OTC制劑”是指2003年2月31日前國家美國食品藥品監督管理局公布的第壹至第六批OTC目錄中呼吸內科範圍內的成人復方制劑，具體品種見下表(復方成分及用量見OTC目錄)。