中國科學院大學華大教育中心
中國科學院大學華大教育中心於2012年由中國科學院大學（原中國科學院研究生院）批準成立，該中心依托深圳華大基因研究院雄厚的科研實力和國際壹流的師資力量，招收培養碩博層次的高端人才。
培養采用中國科學院大學“兩段式”模式，即碩士和博士研究生入學後，先在北京教學園區進行為期半年的基礎課程和學位課程的集中學習，後兩年半在華大教育中心開展科研實踐並完成學位論文。
中心擁有生物信息學、基因組學、生物工程三個碩士培養專業和基因組學博士培養專業，並已招收兩屆碩士研究生。中心兼職博導5人，兼職碩導4人，2014年計劃在以上專業和領域招收全日制學術型碩士、博士研究生和全日制專業型碩士研究生。
本科創新班
華大基因學院與國內10余所高校，如武漢大學、東南大學、華中科技大學、四川大學、電子科大、華南師大、安徽醫科大、暨南大學、中國地質大學（武漢）、等簽署本科創新班聯合培養，培養了大批優秀的創新人才。培養模式分為兩種，“2.5+1.5+X”和“3+1+X”，即學生本科期間前2.5（或3）年在學校學習，後1.5（或1）年在華大進行科研項目實戰培養，X則指本科畢業後，可繼續碩士或博士聯合培養。[span]在創新教育和合作基礎上[span][span]，持續推進與相關高校的工程碩士合作班、科研合作、青年教師培訓等。
在前期良好的合作基礎上，深圳華大基因研究院還與華南理工大學、青島大學等***建“創新學院”。進行本科創新班、碩士、博士的聯合培養。
暑期項目
暑期實習項目
每年7月-8月期間，華大基因學院為國內重點高校（985/211）大二、大三年級，生物、數理、計算機類等專業學生及並接收優秀的境外高校學生提供為期壹個月的華大實習機會。實習期間采取集中培訓+項目實踐的方式，使學生了解華大及生命科學前沿知識，體驗華大項目帶人才的培養模式。同時華大也將通過短期實習選拔優秀創新人才，雙選後優秀者可被進入聯合培養項目或就讀華大教育中心的研究生。
2009~2012期間，暑期實習項目已舉辦四屆，參加實習的學員累計達到600人。2013年暑期實習項目報名工作已經截止，熱誠歡迎有誌從事生命科學研究的各位同學踴躍報名。
夏令營（高中生）
夏令營活動面向重點中學高壹、高二學生招生，於每年7月-8月間開展，為期1-2周。夏令營以專家科普講座與實驗操作為主，目的是為了激發高中生對生命科學領域科研探索的興趣，推動科普教育，提前選拔可能的優秀人才。
夏令營活動已於2012年7月正式開展，面向深圳中學等重點合作中學招收高壹、高二學生13人。 港中大-華大跨組學創新研究院
香港中文大學與華大基因學院合作建立香港中文大學--華大跨組學創新研究院，以培養碩博研究生（目前是修課式碩士）為己任。
香港中文大學與華大基因學院***同制定培養方案，***同開展教學。培養方式以修課為主，但課程實踐性強，上機練習多，而且華大基因學院會提供項目實踐機會。
港中大--華大跨組學創新研究院持續合辦修課式碩士課程，擬增設研究式博士課程。第壹屆招生9人，第二屆招生擬錄取26人（華大員工21人），並增招經驗豐富的教師5名任教3門碩士課程。
項目合作式研究生聯合培養
華大基因學院與哥本哈根大學，奧爾胡斯大學等國際性大學建立項目合作，聯合培養碩、博研究生。由華大和合作院校***同選拔優秀人才，以華大員工身份赴國外深造。合作項目以研究為主，華大與合作院校將提供重大科研項目實踐機會。
哥本哈根大學已完成壹屆招生，***24人在讀，奧爾胡斯大學已有4人在讀。
其他合作模式探索/暑期交流等
除上述合作模式之外，華大基因學院還在不斷探索其他的合作方式及渠道。
哈佛大學：承接暑期實習項目，協調接收實習生1人。
澳門大學：擬從合辦碩士課程開始，待溝通***建學院事宜；
澳門科技大學：已簽合作框架協議，進行碩博聯合培養；
香港科技大學：承接RIPS-HK暑期實習項目，接收實習生4人；
伊利諾伊大學香檳分校：組織協調交換培訓課程，17名華大員工將赴美培訓； 除學歷教育之外，華大基因學院還開展以培訓為主的非學歷教育。
與人力資源部***同承擔華大基因全員培訓工作。承接、實施人力資源部整體培訓計劃，實施考核，並對所有考核進行監督。
新員工培訓
定期組織新員工入職培訓，使其了解華大歷史文化、組織架構、福利待遇等，盡快融入華大。
大科學培訓
對華大全員進行大科學理念的培訓。
其他培訓
對華大人力資源培訓計劃中的其他各類培訓組織實施培訓。
學習考試平臺
維護、管理、支持華大學習平臺及考試平臺，供全員學習、考核使用。
考核監督
對華大培訓中需考核的部分，進行監督。 生物信息學培訓
華大基因於2005年起開展生物信息學培訓，迄今為止已成功舉辦100多期生物產業類高端培訓，國內學員達3000人次，國際學員達300多人次。
生物信息學培訓內容有前沿技術/熱點類課程、經典案例分享類課程、技能實操類課程、量身定制類課程。
醫學類培訓
華大基因學院與華大健康及衛生部人才交流中心合作項目，為臨床醫生提供基因組學的前沿性知識，幫助其提升專業技能，並提供與同行相互交流的機會和平臺。考核合格者被授予醫學繼續再教育I類學分。
遺傳咨詢師培訓
華大基因學院的遺傳咨詢師培訓邀請國際知名專家授課，培訓結束後參與者將獲得衛生部頒發結業證書，並被授予醫學繼續再教育I類學分
遺傳咨詢師屬臨床醫學咨詢與健康管理服務類專業醫務人員，以客戶為中心，針對客戶所關註問題，提供較全面的個性化遺傳咨詢等服務。
核酸測序平臺 蛋白質譜平臺
基因操作平臺 細胞學平臺
動物克隆平臺 信息技術平臺 華大基因學院現有高水平專家組成的教師團隊***計48人（含兼職教師），承擔學院本科和研究生的教學工作。有9名教師已被聘為“中國科學院大學華大教育中心”兼職碩博導（其中：博導5名，碩導4名）。
除此之外，學院還在國際上聘請多名高水平專家，短期來華大基因學院從事教學活動，為學生提供了解學科和產業發展的最新方向和動態的機會。 華大基因學院自成立以來，與國內外多所教育機構建立合作，聯合培養優秀人才。如國內的武漢大學，東南大學，華南理工大學，另有香港中文大學、哥本哈根大學、奧胡斯大學、美國加州大學戴維斯分校等國際知名高校。
華大基因學院與其他院校聯合培養的學生在國際頂尖學術期刊（以CNNS為代表）發表文章***48篇，其中第壹作者32篇；聯合培養研究生在BGI為署名單位發表的文章***計265篇，其中第壹作者占152篇。以本科創新班為例，已在CNNS系列雜誌上參與發表科研文章達26篇其中8篇為第壹/並列第壹作者。
華大基因學院的學生***參加發明專利44項，***參與開發軟件著作權45項。 2012年10月7日，由麻省理工學院和BioBricks基金會主辦的國際遺傳工程機器大賽（International Genetically Engineering Machine Competition，簡稱iGEM）亞洲賽區中，由華大基因學院創新班學員組成的“Shenzhen隊”憑借“酵母人工細胞器YAO #1.0”課題，首次參賽即在57支隊伍中脫穎而出，斬獲金牌。