植物科學學院是2004年原中國人民解放軍軍需大學農副業生產系並入吉林大學後，整合優勢學科成立的。學院包括農學、理工類，涉及生物學、作物學、植物保護、農業資源利用、園藝學、機械工程。學院下設作物系、植保系、園藝系、農業資源與環境系、基礎生物系、機械工程及其自動化系、農業教研實習基地和機械工程教學與實驗實習基地。
作物科學系
作物系成立於1988。2004年，根據軍隊建設發展需要，隨解放軍軍需大學整體調入地方。現為吉林大學農學部植物科學學院作物系，下設遺傳育種、作物生產、氣象等教研室。
作物系師資力量雄厚，教職工10人，其中教授3人，講師2人，農藝師2人，助教1人，助理實驗員1人，實驗技術人員1人。在職教師中，具有博士學位的教師2人，正在攻讀博士學位的教師2人，具有碩士學位的教師2人，正在攻讀碩士學位的教師3人。
在原有農學專業的基礎上，經過十余年的積累和努力，專業改革和調整已基本完成，並於2005年成功申請設立了作物學碩士學位授權點。農學專業包括作物遺傳育種、作物栽培和農業氣象學，其中作物遺傳育種是我院歷史上最早的碩士學位授權點之壹。開設的主要課程有基礎生物化學、植物生理學、植物學、田間試驗與統計、普通生態學、普通遺傳學、作物育種、作物栽培與耕作、種子科學、微生物學、植物生物技術、基因工程、農業經濟學、農業機械化、生物信息學等。該學科的主要研究方向包括:基因工程在植物育種中的應用、植物營養的遺傳改良、植物分子標記的應用、農作物生產新技術的研究和農作物新品種的培育。
作物系自成立以來，先後承擔和參與國家863計劃、國家自然科學基金、省部級科研項目20余項，科研經費總計約500萬元。先後獲得軍隊科技進步二等獎6項、三等獎3項，全軍教學成果二等獎1項，國家專利申請2項，省級科技成果獎2項。在國內外學術期刊上發表論文近百篇。作物系與中國軍事醫學科學院、南京農業大學、吉林省農業科學院、中國科學院東北地理與農業生態研究所等教學科研單位有長期穩定的科研合作。與日本農林水產省北陸農業研究中心保持定期學術交流和交流。
農業是國民經濟的基礎，21世紀是生物科學的世紀。作物科學作為生命科學的壹部分，與植物生物技術和計算機科學緊密結合，為資源利用、品種選育、作物生產等提供了更廣闊的發展前景。
學生畢業後可在高等院校和科研院所從事教學和科研工作，農業管理部門從事管理和技術推廣工作，各級種子公司從事種子管理工作，國內外貿易公司從事農產品貿易工作，新聞出版單位從事農業科技知識的推廣和普及工作。也可以申請本專業或相近專業的碩士學位繼續深造。
作物科學系將以作物遺傳育種學科建設為核心，兼顧作物栽培學、農學和新研究方向的培養，強化學科條件建設和人才建設兩大基礎，引進和培養更多在國內具有壹定影響力的學術帶頭人，顯著提高科學研究整體水平和技術創新能力，推動學科建設跨越式發展，使作物科學系在教學和研究方面達到國內領先水平。
植物保護系統
植物保護系隸屬於吉林大學植物科學學院。植物保護系是解放軍軍事大學移交地方政府後成立的，2004年開始招收植物保護專業本科生。植物保護系前身是中國人民解放軍農牧大學植物保護教研室。解放軍農牧大學植物保護教研室自成立以來，歷經10多年，於1999年與微生物教研室合並，隊伍不斷擴大。
植物保護系有三個教研室:植物病理學、昆蟲學和殺蟲劑。該系是吉林大學農學部植物科學學院中壹個歷史很短的系。擁有碩士學位(植物病理學)，培養了30多名研究生。學科帶頭人為植物科學學院現任院長潘宏羽教授，現有專任教師全部具有或正在攻讀博士學位。
植物保護系目前承擔普通昆蟲學、普通植物病理學、農業昆蟲學、農業植物病理學、植物化學保護、分子植物病理學、病害流行病學、害蟲生物防治、植物病害研究方法、昆蟲研究方法等本科和研究生課程。植物保護系有四個專業研究室和實驗室，包括有害生物綜合防治研究中心和植物保護研究室。這些實驗室設備齊全，總價值超過200萬元。主要從事分子植物病理學、病蟲害綜合防治、資源昆蟲學及其利用、昆蟲病毒學、農藥殘留與分析。
從1995年至今，* * *共承擔科研項目20余項，其中國家自然科學基金3項，省部級項目14項。目前承擔國家自然科學基金、教育部、吉林省科技廳、總後軍需部等科研項目，研究經費1萬余元。教學和科研取得了很大進步。近年來，* * *獲得省級科技進步獎1項，軍隊科技進步獎3項，國家級教學成果獎1項，省部級教學成果獎3項，編著著作6部，在國內外學術期刊發表論文60篇，其中SCI篇，EI 3篇。
多年來，植保系與中國農業大學、南京農業大學、中國農業科學院、吉林農業大學等單位建立了良好穩定的合作關系，定期進行學術交流和學術交流。
園藝系簡介
園藝專業是在原解放軍軍需大學農業與農機系園藝教研室的基礎上建立起來的。先後為農學專業、農副業專業開設了蔬菜栽培、果樹栽培等課程，在植物無土栽培、綠色食品和蔬菜生產研究方面形成了特色。在科技普及和咨詢服務方面形成了優勢，為部隊和邊遠艱苦地區農村的科技服務做出了突出貢獻。現為吉林大學植物科學學院園藝專業，承擔園藝學、農學、植物保護、設施園藝、園藝通論、園藝植物育種、觀賞園藝、景觀規劃與設計、園林工程、果樹栽培、蔬菜栽培、花卉栽培、草坪學等課程。
系裏有7名教師，其中教授1，副教授2，講師3，助教1。設有園藝植物栽培、園藝植物育種、觀賞園藝和景觀規劃設計等教研室。園藝專業人員長期從事無土栽培、綠色食品生產、園藝設施、觀賞園藝、景觀規劃設計等方面的科學研究。他主持了10多個項目。先後獲得軍隊科技進步二等獎2項，吉林省科技進步三等獎1項，發表論文50余篇，編寫專著10余部。
目前，主要研究方向:
1，利用現代生物技術和傳統理化技術開展園藝植物種質資源創新研究；
2.蔬菜花卉無土栽培技術主要研究蔬菜花卉無土栽培的機理、營養液配方的開發和無土栽培設施的設計；
3.綠色食品蔬菜生產技術研究:從育種入手，培育抗病品種和有毒有害物質濃度低的品種，從根本上控制蔬菜產品中有毒有害物質的積累。目前已從大白菜和綠葉蔬菜中篩選出有價值的材料。同時，對綠色食品蔬菜的栽培機理進行了研究。
4.保護地果蔬、黃瓜專用品種選育研究主要針對保護地的環境特點和栽培季節，培育抗病、耐低溫弱光、適合保護地的高產品種；
5.觀賞園藝植物種苗快速繁殖技術研究以抗病性強、生長勢強、花形花色美觀均勻為育種目標，在球根海棠、麗格海棠上培育出了自己的原始品種。同時，利用克隆技術快速繁殖球根海棠幼苗。在蝴蝶蘭、大花蕙蘭、石斛等方面培育自己的原種，創造條件出口創匯；
6.長白山野生園藝植物生物多樣性的研究與利用:對東北地區野生植物中的藥用、食用和觀賞植物的多樣性及其應用進行了研究。同時，開發利用抗病基因資源。
培養學生的畢業去向
本專業學生畢業後可面向科研機構、高校、政府機關、果樹、蔬菜、花卉生產單位、農業旅遊企業、農業高新技術示範園區、農業技術推廣部門及相關單位，也可報考園藝、生物專業研究生。畢業生可從事果樹、蔬菜、觀賞園藝植物栽培、城市園林設計、育種、生產、管理、教學、科研、技術推廣等多種崗位。
農業資源與環境科學系簡介
我們部門成立於1988。2004年，根據軍隊建設發展需要，與解放軍軍需大學整體劃轉地方，並入吉林大學，整合優勢學科。現隸屬於吉林大學植物科學學院。我系現在可以招收不同層次的學生，如植物學博士、植物營養學碩士、農業資源利用農業推廣碩士、農業資源與環境本科。
本系專任教師7人，其中教授1人，副教授3人，講師3人。除了1，都是博士。博士生導師1人，碩士生導師4人，客座教授2人。
我系工作人員長期從事土壤、植物營養和農業環境保護方面的教學和科研工作，為研究生和本科生講授過植物營養與施肥、土壤學、土壤肥料學、農業環境保護、高等植物營養學、植物營養的遺傳改良、植物營養的土壤化學等課程。對植物抗逆(鋁毒)和化感作用(連作障礙)、養分高效利用(低鉀、新型肥料)、微生物在環境中的應用等生理生化機制進行了系統深入的研究。近年來主持和參與國家九五科技攻關項目、國家自然科學基金、留學基金、日本研究所資助項目、企業橫向課題等國內外科研項目20余項。獲軍隊科技進步二等獎、黑龍江省科技壹等獎，出版教材、主編書籍4部。近5年來，在國內外學術期刊上發表論文近100篇，其中SCI外文期刊收錄12篇，EI收錄3篇。目前，國家自然科學基金、省部級、企業橫向課題等在研項目10余項，經費百萬元以上。
多年來，我系與中國科學院、浙江大學、中國農業大學、南京農業大學、華南農業大學等相關研究所建立了穩定的科研合作關系，並與日本岡山大學、丹麥皇家獸醫和農業大學等多所國外大學或科研單位保持著定期的學術交流。
我系涵蓋農學和理學兩大學科，包括植物營養和環境科學兩個學科。它是壹門綜合性強、適應性廣、發展前景大的新興學科。
主要研究方向:方向1。植物營養生態學
(1)植物抗逆的生理和分子生物學機制:從生理、生化和分子水平研究植物對低鉀、鋁毒害的抗逆機制。特別是對大豆在鋁毒脅迫下的脅迫響應特征和機制進行了系統研究，該方向得到了兩項國家自然科學基金的資助。
(2)植物化感作用在農業可持續發展中的應用:利用生物間的化感作用，構建抗病蟲雜草的農業生態系統，從而減少人工化學品的投入，實現環境友好型農業的持續和諧發展。
方向二。農業生態環境
(1)環境微生物技術與生物工程:研究土壤病原微生物對作物生長的抑制機理，同時篩選和應用有益微生物進行生態農業建設和環境汙染生物修復。
(2)新型肥料研發:主要研究內容是環保型緩釋肥料的研發。
(3)營養資源管理
(4)土壤侵蝕和水土環境效應。
基礎生物學系簡介
基礎生物學系隸屬於吉林大學農學部植物科學學院。它的前身最早可以追溯到1953，經過50多年的建設和發展。
基礎生物學部現有生物學博士後流動站1個，植物學博士點1個，碩士點2個，教師10人，其中博士生導師2人，碩士生導師3人。目前學科帶頭人為中國植物學會常務理事、吉林省植物學會和遺傳學會副理事長、文職少將、博士生導師李艷芳教授。學術帶頭人為吉林省遺傳學會理事、基礎生物學系主任、博士生導師袁亞平教授。
該系為研究生和本科生提供不同水平的課程，包括植物學、生物學、微生物學、植物生物化學、植物生理學、植物生物技術、基因工程原理和技術、植物細胞和組織培養、轉基因植物及其安全性、植物基因組學和植物蛋白質基因組學。
目前，該系設有植物生物技術實驗室、生物學實驗室、植物生理生化實驗室、細胞工程實驗室、植物基因工程研究中心等。，配有完整的實驗儀器，總價值300多萬元。主要從事基因分離與克隆、基因表達調控機制分析、分子標記、蛋白質分析、植物轉基因技術、細胞工程技術、染色體工程技術、植物分子育種等研究工作。承擔植物轉基因研究、中試及產業化國家專項、國家“863”項目青年基金、國家自然科學基金、教育部、吉林省科技廳、吉林省農業廳、吉林省林業廳項目等40余項課題研究工作，累計獲得科研經費700多萬元。經過多年的努力，他獲得了20多項各級科研成果獎。多年來，為軍隊和地方政府培養了50多名博士生和碩士生。目前有博士後、博士生、碩士生30余人。
多年來，基礎生物學部與中國科學院植物研究所、北京大學、清華大學、復旦大學、中國農業科學院、東北師範大學等建立了穩定的科研合作關系，並與國外多所大學和科研單位保持著定期的學術交流。
機械工程及其自動化系簡介
機械工程及其自動化系主要由原軍事大學軍事管理系軍事裝備技術與管理系和機械基礎系組建而成，現隸屬於吉林大學農業系植物科學學院。目前本系主要教學對象為2004級機械工程及其自動化專業，同時承擔農學、植保、園藝學、農業資源與環境、食品科學與工程、食品質量與安全、動物科學等專業的相關課程。
師資隊伍中，目前科室專任教師5人，其中高級職稱1人，中級職稱1人，初級職稱3人。碩士1，博士1，碩士2；碩士生導師1。由於師資力量不足，該系與吉林大學機械科學與工程學院長期合作，保證壹流的教學質量和教學水平。
該系主要有電工電子實驗室、自動控制實驗室、機械制圖室和機械零件實驗室。機械工程教學實驗實習基地作為植物科學學院的獨立單位，在機械工程及其自動化系的教學中發揮了巨大的作用。同時也促成了該系部分實驗課和選修課的蓬勃發展，受到學生的壹致好評。
機械工程及其自動化專業的培養目標是培養在機械工程領域從事設計、制造、科技開發、應用研究和管理的復合型高級人才。
機械工程及其自動化專業融合了機電壹體化，知識面廣，知識水平高，適應性強，社會需求大。畢業生可以到國家機關、工業企業、經貿管理、科研機構和高等院校從事機械設計制造、研發、貿易、教學、科研和管理工作。