因為核酸檢測可以準確的預測和估計病毒的傳染性和結果，所以現在在國內很多人群的篩查中，核酸檢測都被作為評估結果。但隨著防控形勢的日益嚴峻，抗原檢測也可以作為壹種輔助檢測手段。雖然抗原檢測的準確率不高，但是在大規模人群的初篩中有非常好的表現和作用。
壹:核酸檢測更有效，因為對設備和采集器的要求更高。
核酸檢測因其具有早期診斷、高敏感性和特異性的突出特點，是診斷新冠肺炎的重要標準之壹。核酸檢測采用實時熒光定量RT-PCR技術。這項技術非常有用，有助於新冠肺炎的初步發現和判斷。但缺點是高靈敏度RT-PCR儀器價格昂貴，對相關實驗室的潔凈度和操作人員要求高，檢測時間長。壹項測試通常需要4-6個小時才能得到結果。
二:抗原檢測比核酸檢測有更快的初步檢驗結果，但缺點是準確率低。
抗原檢測可以在檢測結果上快速檢測出人體樣本中是否含有新型冠狀病毒，對設備和人員要求低。抗原檢測采用的雙抗體夾心法，會用兩種抗原特異性抗體來識別和結合壹個抗原靶點的不同表位，可以降低交叉反應的概率，有效提高其特異性。這樣可以很快得到檢測結果。
三:抗原檢測只適合很多人的大規模基礎診斷，最終診斷還是要靠核酸檢測。
在日常生活中，由於核酸檢測的檢測時間不短，當大規模人群進行相關檢測時，可能會出現聚集性感染的風險，此時可通過抗原檢測進行病毒的快速人群篩查和初步結構診斷。這對於減輕防控壓力，保障人員分流，是很有幫助的。