(1)溫湯浸種這是最傳統的種子處理方法，即在55℃的熱水中浸種。具體方法如下:先將壹份冷水(常溫，5-10倍種子量)倒入盛有種子的容器中，再倒入兩份開水(可達55-60℃)，邊倒水邊用棒狀溫度計單向攪拌，然後隨時加熱水，在55℃保持10分鐘，然後自然降至30℃浸泡種子6500分鐘。
(2)熱水燙種:將種子放入容器中，先倒入壹些冷水浸泡種子，然後倒入開水，用棒狀溫度計沿壹個方向攪拌，使溫度達到70 ~ 75℃，保持2分鐘，再倒入冷水，使水溫降至30℃，繼續浸泡12小時。
以上兩種方法的特點是簡單，成本低。
(3)幹熱處理苦瓜種子未完全成熟時，在太陽下曬幹(50 ~ 60℃幹熱處理)4小時左右，既能促進後熟，又能增產。這種方法在農民自己收集種子時非常簡單實用。
(4)化學處理可分為拌種和浸種兩種方式，主要用於提高發芽率，消毒種子，促進生長健康。
農藥拌種壹般用克菌丹、五氯硝基苯、多菌靈、撲爾敏、敵百蟲、福美雙、敵百蟲等殺菌劑消毒，用量為種子重量的0.2% ~ 0.3%，適合幹混，即農藥和種子都是幹的。這樣不容易造成藥害。混有藥粉的種子應直接播種。
用藥液浸種時，必須嚴格控制藥液濃度和浸種時間，否則容易引起藥害。壹般種子先用清水浸泡3-4小時，再用藥液浸泡，然後按規定時間取出種子，用清水反復沖洗，直至無藥味。常用的殺菌劑有福爾馬林(40%甲醛)100倍水浸種10 ~ 15分鐘，1%硫酸銅水溶液浸種5分鐘；將病毒滅活(抗病毒病)劑浸泡在10%磷酸三鈉或氫氧化鈉水溶液中20分鐘；催芽劑為0.1%硫脲或5 ~ 10微升/升赤黴素水溶液浸種12小時。
此外，種子可以用500 ~ 700 μ l/L的微量元素水溶液浸泡，如硼酸、硫酸錳、硫酸鋅、鉬酸銨等，能促進種子的生理活性和酶活性，也能使根系發達，幼苗健康發育。