李文均教授長期圍繞微生物資源與生態學方向,主要從事放線菌的系統分類、資源利用與生態學研究,創新性成果包括:(1)建立了針對多種特殊生境放線菌的分離方法,對我國西部地區放線菌資源進行系統分離並保存了5萬余株放線菌;(2)先後發現、建立並生效發表了細菌、放線菌新目4個,新科10個,新屬30余個,新種300余個,顯著提高了我國在該領域的國際地位;(3)與科研院所、企業廣泛合作,資源***享,推動了特殊生境放線菌資源的活性篩選和次生代謝產物、酶學等研究;(4)對原核微生物莽草酸通路起源和分子進化、極端環境微生物生態適應性機制進行了深入研究並取得積極進展
先後承擔了包括國家科技部“973”子課題,973前期,國家科技部國際合作重點項目,國家自然科學基金等在內的20余項國家級或省級課題的研究,現在研主持1項科技部國際合作專項,1項國家自然科學基金面上項目,1 項省重點項目及部分橫向合作課題。已在國內外刊物上發表學術論文450余篇(其中SCI源刊論文350余篇),專著3部,受邀撰寫新版伯傑氏系統細菌學手冊(Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology)6章,新版原核微生物(The Prokaryotes)2章,申請專利19件。另外,他還先後榮獲雲南省自然科學壹等獎(2次,分別排名第壹和第三)、教育部自然科學二等獎(排名第壹)、雲南省自然科學三等獎(排名第三)、雲南省青年科技獎、雲南大學伍達觀優秀教師獎、雲南省十大傑出青年提名獎、“雲南省青年五四獎章” 提名獎、雲南省突出貢獻專業技術人才等20余項獎勵 。