與其他貿易壁壘壹樣，綠色壁壘會阻礙國際貿易的發展。設置綠色壁壘後，受限產品的國際貿易量有所下降。但是，如果在設置綠色壁壘之前，這類產品的國際貿易量以壹定的速度下降，並不壹定會導致國際貿易量的絕對量下降。
2、對商品結構和地理方向的影響
總體而言，農產品貿易受綠色壁壘的影響大於工業制成品，勞動密集型產品貿易受綠色壁壘的影響大於技術密集型產品，發展中國家的對外貿易受綠色壁壘的影響大於發達國家本身。這種狀況在壹定程度上影響了國際貿易的商品結構和地理方向的變化，阻礙和損害了發展中國家對外貿易的發展。
3.對進口國的影響
綠色壁壘和其他貿易壁壘壹樣，起到限制進口的作用，使進口國國內市場價格上漲，保護本國市場和生產。因為受汙染的產品被綠色壁壘擋在國門之外，進口國的消費者享受更健康、更安全、更清潔的產品。然而，由於產品價格的上漲，進口國的消費者必須以更高的價格購買他們所需的商品，而有關制造商則從中獲得高額利潤。
4.對出口國的影響
綠色壁壘對出口國不同制造商的影響是不同的。對於轉向清潔生產技術並及時生產綠色產品的制造商來說，他們在市場中處於有利地位。綠色壁壘阻礙了許多國內制造商的出口，競爭對手銳減，出口市場廣闊，國際市場上綠色產品價格上漲，使得綠色產品的制造商補償了由於采用清潔生產技術而增加的成本。對於那些不能及時轉向清潔生產技術而仍然使用舊的汙染生產技術的制造商來說，他們的處境將會嚴重惡化。這類產品國內供大於求，短時間內產品積壓使得價格下跌，產量減少。消費者將從價格中受益，但同時，他們將不得不承擔使用汙染產品帶來的副作用。
5.對中國的影響
近年來，中國的對外貿易正面臨著越來越多來自發達國家甚至發展中國家的綠色貿易壁壘的挑戰。總的來說，綠色貿易壁壘對我國的出口市場份額、貿易機會、企業和商品聲譽產生了負面影響，導致國外消費者對我國部分產品尤其是農產品和食品的信心下降，對我國出口產生了長期的負面影響。具體來說，綠色貿易壁壘對我國外貿的影響主要體現在以下幾個方面:從產品出口的市場範圍來看，我國目前的主要出口方向仍然是日本、美國、東南亞、歐盟、韓國等國家，其出口份額占我國外貿出口總額的80%，而這些國家(或地區)大多是環保主義者和倡導者，也是綠色貿易壁壘的發源地。中國出口商品的市場銷售很容易受到綠色貿易壁壘的影響。從產品出口增速來看，由於我國出口市場較為單壹和固定，壹旦當前市場銷售受到影響，出口增速必然下降，特別是在壹些發達國家專門針對我國部分商品設置綠色貿易壁壘的情況下，這種商品的出口會立即停滯，如果不及時采取應對措施，將會影響整個行業的發展。從企業的出口成本和收益來看，由於綠色貿易壁壘大多以環境標準和標誌的形式出現，要實現其環境標準，獲得其環境標誌，必須投入大量的資金和人力進行技術改造，提高環境質量；同時增加相關檢驗、檢測、認證和公關程序及相關費用，使企業出口產品成本大幅增加，價格優勢大幅削弱，國際市場競爭力喪失，企業出口效益日益下降。從中國對外貿易關系來看，由於綠色貿易壁壘越來越多，中國與主要貿易夥伴之間的貿易摩擦不斷，如果處理不當，將影響雙邊或多邊貿易關系。因此，必須妥善應對綠色貿易壁壘對中國對外貿易的影響。