已發現嘧菌酯對保護地番茄有毒性，番茄苗移栽後2周內應慎用。發現蔬菜白斑病已對嘧菌酯產生抗藥性，連續施藥2次以上效果明顯下降。
嘧菌酯的原藥和化合物已經過了專利期。從2013年3月開始，國內大量廠家開始生產和推廣單劑和復配產品，對其他類型殺菌劑造成了很大沖擊。
國內主要劑型和含量:
25%懸浮劑、50%水分散粒劑和32.5%嘧菌酯苯醚懸浮劑、20%至32%嘧菌酯丙環唑懸浮劑和20%至50%嘧菌酯戊唑醇懸浮劑；10%至50%嘧菌酯·烯酰嗎啉SC/WG等(不包括種子處理)。
功能特點
1.殺菌譜廣:壹藥可治多種疾病，減少用藥量，降低生產成本。
2、增加抗病能力:少生病，生長旺盛，早生早上市。
3.提高抗逆性:氣候惡劣，產量高。
4.延緩衰老:延長收獲期，提高總產量，增加總收入。
5.持效期長:特效期15天，可減少用藥次數，減少蔬菜農殘。
6.高效安全:強內吸滲透效果明顯，天然低毒，安全無汙染。
嘧菌酯的使用方法
嘧菌酯的最佳施藥時間為開花前、開花後和幼果期。使用方法是在霜黴病、早疫病、癰、葉斑病等發病初期。壹般在莖葉上噴灑25%嘧菌酯懸浮劑，每10天壹次，作物每季最多可使用3次。請參考具體的使用說明。
嘧菌酯是壹種新型高效、廣譜內吸性殺菌劑，可用作莖葉噴霧、種子處理和土壤處理。嘧菌酯對真菌界幾乎所有的病原菌都有很好的活性，殺菌譜廣。可用於治療谷類、蔬菜、果樹、花生、馬鈴薯、咖啡、草坪等作物上的各種病害，如白點病、銹病、穎枯病、網斑病、霜黴病、水稻溫病等。具體用量可根據不同作物和病害進行調整。壹般情況下，每畝可施用有效成分2.5-26克..
此外，嘧菌酯還能增加植物的抗病性，有較長的特效期，減少用藥次數和成本，延緩作物衰老，延長收獲期，增加總產量。但需要註意的是，嘧菌酯不能與乳油農藥或矽氧烷增效劑混用。