明世宗朱厚熜重用奸臣嚴嵩，於嘉靖二十壹年(1542)，將南靖大員嚴嵩提升為五營殿大學士，直入文遠閣任內閣首輔。嚴控國事，父子嚴世蕃、爪牙趙文華等結黨營私，殺害名臣良將。他們大肆掠奪，賄賂民眾，以致兵荒馬亂，國庫空虛，導致倭寇襲擾東南沿海，對內對外侵略，民不聊生，使明朝危在旦夕。壹些憂國憂民的官員多次彈劾嚴嵩父子。但由於世宗昏庸，彈劾嚴嵩的人經常遭到毒打、囚禁、流放甚至殺害。於是官員們互相警告，守口如瓶。鄒應龍不顧個人安危，敢於聯合嚴嵩父子，為朝廷鏟除貪官汙吏，危害人民。
嘉靖四十壹年(1562)，明世宗意識到了顏黨的劣跡。當時，嚴嵩年老體衰，他的兒子嚴世蕃主要負責國家事務。世宗因為驕奢淫逸，漸漸疏遠了顏父子，親近了大學者徐階。鄒應龍認為時機已到，於是他去辦公室幫助他參與進來。他大意說:“工部侍郎嚴世蕃，仗著宗族勢力貪婪，賣官鬻爵，向吏部行賄:刑部主事以1.3萬金移送吏部，舉人潘鴻業得知州縣官員以2千金行賄數千萬。平時，兒子金易管得嚴。如遇嚴嵩生日，嚴念經常出百萬美元為其祝壽。
嚴嵩父子原籍袁州(今江西宜春縣)，但在南京、揚州等地，良田美宅數十間，嚴冬以豪仆為首，民怨沸騰。
當樊氏失去母親後，世宗把嚴嵩當成自己的學長，特意留下來照顧他，讓嚴昆幫助他南下。樊氏聚集賓客，擁抱燕姬，載歌載舞，破壞人倫。而胡燕卻把祖母的葬禮當成了壹件奇怪的商品，跑到郵局百般勒索。
現在各地水旱災害，寧夏強震不斷，外敵入侵不斷。內外官員都把人民的脂肪和人民的奶油裝進了嚴的私人口袋。人民怎麽可能不窮？如果我說了不真實的話，我會被殺的。嚴嵩溺愛邪童，應早日放歸田間，以清政治。
明朝的世宗皇帝得知嚴世蕃過著喪服的生活後很反感。當時，正當煉丹師藍道行被皇帝看中幫助她。世宗問藍道行:“今天侍郎明智嗎？”藍道行用伏羲冒充神仙，說:“嚴嵩父子玩弄權術，以致天下亡。”世宗疏遠嚴嵩，信任大學者徐階。當他收到鄒應龍的信，他下令嚴嵩做官，嚴世蕃駐紮在雷州(廣東)。
然而，嚴世蕃沒有到達駐軍，逃回江西。嘉靖四十四年(1565)三月，南靖禦史林潤主政蔣芳。他查出嚴世蕃、羅龍文日夜讒言國事，把巨賊藏在江陽，招募四千勇士，即南通之敵、北方之韃靼，設計不規則。林潤被流放後，世宗暴怒，逮捕了嚴世蕃和羅龍文。並抄了嚴世蕃的財物，得了黃金3.2萬兩，白銀300萬兩，其他珍寶首飾價值百萬，同時罷黜了嚴嵩父子。同年8月，嚴嵩的財產被沒收。兩年後，嚴嵩在墓中老死。
打敗嚴嵩父子後，鄒應龍升任總政治部參事。到了元年(1567)，鄒被任命為禦史副都，掌管江西、江南的燕屯，後升任工部右侍郎。鎮守雲南的錢公對人民暴虐暴虐。朝廷討論，推薦德高望重的人做鎮督，於是鄒應龍被提升為兵部侍郎、右雲南刺史。鄒上任後，公布了穆朝弼的起訴書，穆被逮捕並受到指控。
1572年，宗申·朱翊鈞登基，次年改年號為萬歷。他年僅十歲，大權落在掌管東廠的李思太監鮑鋒手中。得罪了，同時又被禦史郭和送東西的裴誹謗。他被貶到老家，死在家裏。
萬歷十六年(1588)，陜西巡捕王玄到朝廷，認為鄒應龍清正廉明，死後只留下幾畝地和幾間房子，沒有退休金。朝野對此怨聲載道，恢復了鄒的官職，並賜他壹個祭品。