小說獎
首獎（並列）∶李知昂〈可怕的幸福〉，楊慎絢〈阿茲海默診療室〉
三獎（並列）∶徐慶雯〈魔俑〉，陳湘婷〈病〉
佳作∶高誌峰〈Memory Bank〉，陳婉菁〈寬頭〉
評論獎
首獎∶柯喬文〈我，衛斯理－－談倪匡科幻小說中的敘述人稱策略〉
二獎∶張雅琪〈最高段的人性玩法～倪匡專利〉
三獎∶郭宏偉〈嫁接優勢－－倪匡科幻小說吸引力何在？〉
佳作∶向鴻全〈科幻的慰藉－－論倪匡科幻中的中國想象〉，王正良〈科幻與命運的雙向書寫－－從倪匡的《命運》附篇〈十七年〉說起〉 科幻小說創作
首獎∶高誌峰〈上帝競賽〉
二獎∶李崇華〈奇異點〉
三獎（並列）∶陳冠華〈老王〉，黃千耀〈實驗鼠〉
佳作∶李伍薰〈回家〉，楊孟哲〈臺北市立殯儀館〉
科幻與科學論述
首獎∶從缺
二獎（並列）∶葉琬玲〈由911到末日或不朽〉，杜加維〈談「科幻」作為「科學荒謬」的解藥〉
佳作∶李靜 〈科幻、神話與現實〉，羅際揚〈從研究人員看科幻與現實的落差〉，王正良〈科幻與科學的壹線之隔〉 科幻小說創作
首獎∶龍俊榮〈皇陵的秘密〉
二獎∶馬小珊〈上街〉
三獎∶李伍薰〈創造新天地〉
佳作∶王誌玄〈逃亡〉，林兆基〈真相〉，宋易儒〈宇宙歷壹九九九年四月四日〉
科幻電影論述
首獎∶耿壹偉〈關於科幻文學命運的關鍵報告〉
二獎∶黃允中〈企業號．美國制造〉
佳作∶江宗翰〈魔鬼終結者的機器人形象〉，胡培菱〈「因為我愛，所以妳才是」∶《駭客任務》中的救世主認證〉，婁祥麟〈科幻電影中的時空旅行與科學〉 科幻小說創作
首獎（並列）∶陳巍仁〈Ark-T〉，王經意〈百年壹瞬〉
三獎∶潘宜中〈「我」這個混帳無賴〉
佳作∶鄭年亨〈島嶼湖〉，黃顯庭〈子夜巴士〉，陳冠華〈瑪雅〉，楊佩螢〈結婚進行曲〉
科技狂想曲
首獎∶連慶偉〈逛街〉
二獎∶張文哲〈我們的美好閱讀時光〉
佳作∶黃政翰〈十年後的冰箱〉，鄭朝明〈十年後的黑板〉，黃述凱〈車天車地〉
2004國科會科普獎
首獎∶丁鳴舉〈發現液晶〉
二獎∶鄒鎮帆〈尋找真正的魔戒〉
三獎∶吳成第〈飛翔不必靠他人—手擲機〉
佳作∶林守德〈向理性與直覺挑戰的頑皮精靈—綜觀詭譎的悖論〉，徐慎謀〈子非魚，安知魚之樂？從認知科學談我們如何了解別人在想什麽〉，盧昭彰〈無所不在的戴奧辛〉 科幻小說獎
首獎∶魏嘉華〈凱文，我們愛妳〉
二獎∶李宥樓〈人鼠〉
三獎（並列）∶林嘉偉〈我想，我可能會向她求婚。〉、 宋盈儒〈填鴨〉
佳作∶李慶國〈家境〉
科技狂想曲
首獎∶張英〈生物建材〉
二獎∶符敦國〈安如壹號助眠枕〉
三獎∶黃寰〈「女媧補天儀」拯救地球〉
佳作∶余明憲〈2020光明大道〉、陳心禾〈2020年的輔具〉、 譚誠明〈看醫生〉
2005國科會科普獎
首獎∶黃相輔〈美麗新世界－太陽系外的行星系統〉
二獎∶徐誌雲〈瘋狂。妳波折的美麗。〉
三獎（並列）∶吳震坤〈100000 Pluto〉、林宇軒〈美麗「針」世界〉
佳作∶方俊育〈科技改變了什麽？記臺灣鹽業機械化過程〉、李振言〈曙光女神Aurora—極光〉 倪匡科幻獎得獎作品
首獎： 劉碧玲《笨小孩 》
二獎： 洪 平《開心》
三獎： 哆啦蔣《回家》
佳作： 葉 軒《人之所以為人》、蛟 挽《靈藥》、林穗君《截稿前的奇跡》
國科會科普獎
首獎：徐誌雲《As Infectious Disease Strikes（當愛滋長）》
二 獎：從缺
三獎：陳昱成《從沙中可以見到世界嗎？》、陳妍君《黑暗中的燭光：點明過去、照亮未來的超新星》、陳巍仁《恍惚阿飄貼身來——REM與兩種鬼壓床現象》
佳作：王瓊蘭《碳球新世界》、王盛弘《喔，原來是幽門螺旋桿菌！——見證壹個觀念的改變》、林淑娟《蟄伏黑暗十七年，只為美麗二十天》 倪匡科幻獎(小說)
首獎：從缺
二獎：黑米《肥鵝肝》
三獎（並列）：大雷神《氣壯山河》、白謙《天堂之門》、陳李《機械本能》
佳作：祁佳仕《零和》、唐潮《情緒保險公司》、譚劍《免費之城焦慮癥》
2007國科會科普獎
首獎：郭文華《標準鍵盤：在科技與社會中擺蕩的人間尺度》
二獎：陳柏年《電腦棋王的智慧之樹》
三獎：邱誌郁《飄浪天涯的俠客》
佳作：簡宗奇《史上最美的科學實驗》、洪美惠《都是光線惹的禍》、鄧榮坤《蓋斑鬥魚》 倪匡科幻獎(小說)
首獎：從缺
二獎：高竹嵐《火金姑，叼位去？》
三獎：吳誰《食》
佳作：柚臻《聲》、李興春《強盜邏輯》、湖南蟲《隨身碟愛人》、夏霏《床邊故事》 倪匡科幻獎(小說)
首獎：丁丁蟲《死亡考試》
二獎：楊 英《朝朝暮暮，暮暮朝朝》
三獎（並列）：寶利瑪《純潔行銷》、小 麥《客星》
佳作：柚 臻《無毛猴子》、TG《數學家的遺囑》、夜透紫《Presque Vu》
第十屆（2010年）
倪匡科幻獎(小說)
首獎：壹通《出不來的遊戲》
二獎：烏奴奴《宅男戰爭》
三獎：陳浩基《時間就是金錢》
佳作：翼走《愛刑》、李維明《米和老米的那些事兒》、陶若舟《創世遊戲》、吳誰《猶大福音 》