本題主要考查發明專利的授權條件，為重要考點。
①專利法保護發明、實用新型和外觀設計三類客體。發明包括產品發明、方法發明和改進發明三種。《專利法》第2條第二款規定：“發明，是指對產品、方法或者其改進所提出的新的技術方案。”專利法意義上的發明，系符合下列三個條件的智力成果：第壹，必須是正確利用自然規律（主要指物理規律和化學規律）的結果；第二，必須是壹種技術方案（“技術方案”是對要解決的技術問題所采用的利用了自然規律的技術手段的集合，其能夠解決技術問題，獲得符合自然規律的技術效果）；第三，能夠被較為穩定地重復實施。A選項中，甲設計的新交通規則，並未利用自然規律，不屬於技術方案，不能被授予發明專利權。故A選項錯誤。
②根據《專利法》第25條第壹款第（三）項之規定，“疾病的診斷和治療方法”，不授予專利權。但是，藥品、醫療器械等，符合授權條件的，仍可授予發明專利權或者實用新型專利權。心臟起搏器屬於醫療器械。故B選項錯誤。
③根據《專利法》第25條第壹款第（四）項之規定，“動物和植物品種”，不授予專利權。微生物（包括細菌、放線菌、真菌、病毒、原生動物、藻類等）既不屬於動物，也不屬於植物，因而，微生物不屬於《專利法》第25條第壹款第（四）項所列的情況。同時，根據《專利法》第25條第壹款第（壹）項之規定，“科學發現”，不授予專利權。據此，未經人類任何技術處理而存在於自然界的微生物，即使被首次發現，此種發現屬於科學發現，不能被授予專利權；但是，當微生物經過分離成為純培養物，並且具有特定的工業用途時，微生物本身可以授予發明專利權。C選項中，丙通過轉基因方法合成的新型細菌，可以被授予發明專利權。故C選項錯誤。
④《專利法》第2條第三款規定：“實用新型，是指對產品的形狀、構造或者其結合所提出的適於實用的新的技術方案。”《專利法》第2條第四款規定：“外觀設計，是指對產品的整體或者局部的形狀、圖案或者其結合以及色彩與形狀、圖案的結合所作出的富有美感並適於工業應用的新設計。”D選項中，丁設計的兒童水杯所采用的形狀、構造，在符合授權條件時，可授予實用新型專利權；丁設計的兒童水杯所采用的形狀、圖案或者其結合以及色彩與形狀、圖案的結合，在符合授權條件時，亦可授予外觀設計專利權。故D選項正確。
⑤綜上，本題的正確答案為D。