清華大學自動化專業是壹個很好的專業，可以說清華大學自動化專業是國內自動化專業首屈壹指的。
首先，從師資力量上來講，目前（根據公開資料）自動化系的老師中，有中國科學院院士2人（李衍達教授、管曉宏教授），中國工程院院士2人（吳澄教授、戴瓊海教授），教授、研究員40人，副教授、副研究員32人，其中包括教育部長江特聘教授1人、國家傑出青年基金獲得者12人，教育部“新世紀優秀人才支持計劃”獲得者13人。這個師資力量。這個配置，別說其他學校同專業可以媲美，就是pk掉壹所普通高校也綽綽有余了。
從專業設置來說，目前清華大學自動化系的壹級學科為“控制科學與工程”，在2001年全國重點學科評審中，“控制理論與控制工程”和“模式識別與智能系統”兩個二級學科均排名第壹。在2006年，2012年兩次全國壹級學科的評估中我系“控制科學與工程”學科名列全國第壹。目前，該壹級學科下設“控制理論與控制工程”、“模式識別與智能系統”、“系統工程”、“檢測技術與自動裝置”、“導航、制導與控制”、“企業信息化系統與工程”、“生物信息學”七個二級學科。這個第壹名的評定是國家認可的，應該很有說服力。
從科研能力和獲獎情況來看。自動化系先後承擔了數百項國家級科研項目,達國際先進水平的62項，屬國內首創的41項，獲國家三大獎的有14項，獲省部級獎53項，獲國內外專利62項。其中，離散事件動態系統的優化理論與方法項目獲得國家自然科學二等獎，地球物理信號處理與識別方法及其應用、關於ARMA模型辨識與諧波恢復的研究等項目獲得國家自然科學四等獎；2000年中國經濟結構的定量分析、城市智能交通管理指揮控制系統等項目獲國家科技進步壹等獎；自適應和專家系統相結合的高爐鐵水含矽量預報系統、CIMS實驗系統的軟件開發及信息集成、加速紡機產品結構優化升級的信息集成與虛擬產品開發技術、大規模復雜生產過程智能調度與優化技術研究及應用等項目分獲國家科技進步二等獎；基於網絡融合的流媒體服務新技術項目獲國家發明二等獎，新型熱水熱量指示積算儀項目獲國家發明三等獎。