1，抗蟲轉基因植物
2001，轉基因抗蟲棉在取得巨大成就的基礎上又有了新的突破。中國農業科學院生物技術研究所的抗蟲棉基因“編碼殺蟲蛋白融合基因及表達載體及其應用”專利獲得國家知識產權局和世界知識產權組織頒發的中國專利金獎。同時，雙價轉基因抗蟲棉SGK321也通過了河北省品種審定委員會的審定，標誌著我國在雙基因抗蟲棉研究領域處於國際領先地位。目前，SGK321已通過農業轉基因生物安全評價，並已在山西、河北、山東、河南、安徽等地獲準商業化生產，在湖北環境釋放。根據2000年和2001年區域試驗結果，SGK321早熟性明顯優於其他品種，霜前皮棉畝產75.4公斤，相當於對照抗蟲雜交種的93.4%。該品種纖維品質好，長度29.2 mm，比強度29.4 cm/tex，馬克隆值4.8，抗蟲性突出。
到目前為止，我國已審定抗蟲棉品種14個，其中單價棉11個。分別是:GK1(郭康1)、GK12(郭康12)、GK19(郭康19)、GK22(郭康22)、GK30(魯棉)。GKz10(魯棉研15號)、GKz13(魯RH-1)、GKz6(中棉所38號)、GKz8(南康3號)；二價棉有3個，分別是:sGK321、sGK9708(中棉所41)、sGK5(欣彥96-48)。這些抗蟲棉品種對棉鈴蟲的抗性強，品質性狀好，產量高。同時培育了壹批具有較強競爭力的抗蟲棉品種，包括兩個雜交棉品種(魯H9513、中抗雜5號)和兩個常規棉品種(ZGK9708、魯S6145)。此外，還有6個有潛力的品種和4個雜交棉正在參加國家區域試驗。2001國產抗蟲棉已在河北、河南、山西、山東、湖南、湖北、江蘇、安徽、新疆、遼寧等17省市推廣，占抗蟲棉國內市場份額的43.3%。加上孟山都的抗蟲棉，2001年，轉基因抗蟲棉種植面積達到全國棉花種植面積的31%，農戶超過350萬。
在抗蟲轉基因水稻方面，中國科學院遺傳與發育生物學研究所研制的轉SCK基因(修飾豇豆蛋白酶抑制劑基因)抗蟲水稻在福建連續試驗了5年。經鑒定，其對二化螟的田間防效為90-100%，對稻縱卷葉螟的抗性為81-100%，對二化螟的防效為62.6-63.9%，對二化螟的防效為83.9%。鑒於目前的政策原因，還不能大規模推廣種植，但已經在很多地區、很多點進行了田間試驗。轉基因大米的食品安全檢測已基本完成，結果顯示轉基因大米與常規大米無明顯差異。目前，非選擇性標記、高表達、多價抗蟲基因等轉基因水稻新品種正在進壹步開發。
中國農業大學從Bt菌株中克隆了壹個新的沈默殺蟲基因cry1Ie1。該基因表達的毒蛋白對亞洲玉米螟表現出很高的殺蟲活性，其在分類學上作為模式基因的地位已在國際上得到確認。該基因及其與cry1A基因的組合已申請國家發明專利。在此基礎上，進壹步完成了cry1Ie1和cry1Ac基因的密碼子改造以及原核和真核表達載體的構建，改造後基因的殺蟲活性鑒定工作正在進行中。