筆者認為，在采取自主創新的重大行動之前，必須有壹個正確的認識。本文談壹些關於自主創新的認知問題，希望能引起更多的關註。
堅定不移地排除幹擾
中國的自主創新受到了兩方面的幹擾。壹方面，幹擾主要表現在將科技問題“泛政治化”，無視或輕視經濟全球化的發展趨勢，強調壹切從零開始，強調所謂的“完全自主知識產權”。在制定標準的過程中，這種幹涉表現為不強調公開原則，看似維護國家利益，實則維護小單位、小團體的利益。這種幹涉很可怕，因為它打著“愛國”的旗號，總是給對手貼上“不愛國”的標簽。
另壹方面，幹擾主要表現在西方發達國家對中國缺乏技術封鎖和遏制，國與國之間遏制與反遏制的嚴重鬥爭被視為只是壹種所需商品的商業交換；另壹方面，又看不起中國的自主發展能力，把科技發展的希望寄托在技術引進上。國內壹些主流經濟學家認為，中國R&D成本高於國外，技術可以像資本壹樣流動，關鍵技術也可以通過引進獲得。長期以來，中國的技術來源應該主要依靠外國。目前只能以勞動密集型加工產業為主，先提高產業要素稟賦而不是攻克關鍵技術，資金和人才積累多了才能強調自主創新。經濟學家通過分析產業的比較優勢來強調勞動密集型加工業對當前經濟的重要性是合理的，但他們得出的中國R&D成本壹定比國外高，大部分關鍵技術可以進口的結論可能是站不住腳的。
自主創新的對立面不是“開放式創新”。自主創新不排斥開放和集成，集成技術也可以有自主創新。自主創新不是鼓勵從零開始，對引進技術的消化吸收和提高也是自主創新的組成部分。自主發展不等於自主創新。自主開發的成果不僅不壹定擁有知識產權，而且可能侵犯他人的知識產權，自己的知識產權也可能包括引用他人的專利權。提倡“自主創新”，主要是指盡量避免完全受制於人，減少“路徑依賴”。
有信心，有勇氣，有策略。
通過提高自主創新能力來增強國家競爭力的重任，已經落在了當代科研人員的肩上，尤其是應該發揮主導作用的國家科研機構的科研人員。
然而，中國的研究人員能否肩負起這壹重任，這是壹個信心和勇氣的問題。壹些學者在討論國家中長期科技規劃時，反對提“勇氣”，怕發展出“人有多大膽，地有多高產”的誇張。但筆者的體會是，自信是高科技研究成功的基本條件。我們完全有能力做出世界級的自主創新成果，為國家排憂解難，為企業提供核心技術和關鍵技術。我們的人力物力是有限的，不可能同時在很多方向做到世界壹流，但我們在壹些選定的方向上做到了或接近了世界壹流。然而，中國仍有相當壹部分人(包括年輕人)對中國掌握核心高技術的能力缺乏信心。每當我們發表壹項與國外相比的先進成果時，網頁上總會出現許多諷刺的評論。看來中國人天生就矮。與韓國等自信心較強的國家相比，中國自主創新的主要障礙是自信心不足，“他山之石，可以攻玉”勇氣。很多事情不是做不到，而是不敢。
說到自信和勇氣，並不是提倡不切實際的魯莽，更不是關起門來吹噓。勇氣必須與策略相結合才能取勝。《孫子兵法》說:“夫戰之前，廟為勝者，過也；如果神廟在戰前沒有取得勝利，那就太少了。”“廟算”就是戰略規劃，“廟算勝”就是戰前做出優於他人的決策。對於自主創新，所謂“廟算”，就是先決定做什麽。全世界有很多聰明的人，我們想做的事情可能別人早就做了，甚至取得了成果。我們真正希望產生重大影響的科研方向並不多。結果的價值很大程度上取決於做不做。學費上的彎路，大多是因為事先不知道怎麽辦，也就是“廟多不勝數”。
“廟算”的另壹個重要方面是“如何做”，即如何組織大型科研項目，如何在實際科研工作中實施“專利、標準、人才”戰略。近年來，各單位的專利申請大幅增加，這是壹個很大的進步。但專利申請是科技領域的肉搏戰，必須講究策略。我們申請的很多分散的專利，並沒有形成壹個自我保護的專利群，別人很容易繞過。而對於國外公司現有的專利，我們缺乏深入細致的分析，往往找不到科研的突破口，做了很多無用功。我們應該力爭技術領先，將我們的專利技術融入新標準。所謂的自主可控技術，所謂的骨幹和主導作用，很大程度上體現在制定標準時不受制於人，而是建立在平等協商的基礎上，真正實現“換珍珠換瑪瑙”的技術發展路線。
創新可以標誌著新的飛躍和追趕。
自主創新必須抓住機遇。在20世紀80年代和90年代，主要的跨國公司和發達國家的政府投入巨額資金發展信息技術。那時候信息技術真的是突飛猛進。正如IBM前總裁郭士納所說，信息產業被技術控制到了瘋狂的地步。當時我們國家沒有人力物力，在信息技術和工業快速崛起的時期，我們很難趕上先進國家。進入21世紀以來，信息產業面臨重大轉折，這是我們實現跨越發展的難得機遇。所謂“飛躍”，往往不是發生在競爭的同壹個方向，而是發生在技術轉向的時機。壹般來說，斜著過才能追上。長期以來，中國信息領域采取的策略基本上是“美國的今天就是我們的明天”，難以縮小差距。我們的自主創新應該選擇不同於國外的信息產品，也就是說，只有創新才能標誌著新。
基於追求高利潤的企業本質，跨國公司更喜歡或者更擅長制造滿足少數高消費人群的高性能新產品。當信息技術進入廣泛普及階段，跨國公司要開發包括低收入人群在內的數十億普通人都買得起的信息產品，可能就沒有過去那麽多的投入和精力去開發低成本產品了。
低成本和高性能壹樣，需要發展高科技。中國是低成本產品的最大市場，滿足中國中低收入者的信息消費需求是中國信息技術自主創新的最大動力，也是我們難得的機遇。信息產品，尤其是集成電路和軟件，不同於汽車等傳統產品。研發中往往很難獲得第壹個商業化的樣品，但以後很容易大量復制。也就是說，研發成本對降低產品成本具有決定性的意義。
關鍵是完善產業鏈，營造創新環境。
提高自主創新能力是壹項系統工程，涉及政府、企業、科研院所、高校等方方面面，必須調動各方面的積極性。
技術創新是整個自主創新價值鏈中的壹個環節。企業是技術創新的主體，這意味著技術創新的投入主要依靠企業，也意味著企業通過對市場的了解得出技術創新的方向。因此，無論是政府還是企業，都不應該以“課題”為由增加政府對科技的直接投入。我國企業財力不足，合理的做法是將部分公共財政支出給具有開發能力的重點高新技術企業，進行關鍵技術攻關，促進這些骨幹企業盡快形成國際競爭力。但是，更好的體現政府支持的方式是以適當的方式用企業的科研投入來抵消稅收負擔。目前，中國企業直接獲得的政府研發資金多於其R&D；對投入的稅收減免。世界各國的通行做法是企業自行投資研發；d資金越多，通過減稅獲得的政府支持就越多，從而促使企業加大研發投入。如果把納稅人的錢，包括比大企業更困難的中小企業繳納的稅款，轉移到重點企業進行競品開發，是違背公平原則的。
要想在高科技研究上取得巨大成就，必須把科研鏈和產業鏈作為壹個整體來考慮——我們可以統稱為創新鏈，我們必須有壹個整體戰略。自主創新的成敗往往不取決於單項技術的突破能力，而取決於創新鏈的整體規劃能力。不能等珍珠培育加工好了再考慮怎麽串成項鏈，而是要根據項鏈的要求來加工珍珠。
目前國家科研機構、高校、企業在創新價值鏈中的缺位和錯位並存，既有兩張皮的問題，也有向下定位的問題。國家科研機構只有定位為核心技術和關鍵技術，才能真正發揮引領和骨幹作用。社會上有壹種觀點認為，國家越是支持研究型大學和國家科研機構，“兩張皮”就會越嚴重。這是壹個誤解。以前中國的高校和科研院所給企業提供的技術不多，不是核心技術和關鍵技術研究太多，而是真正在市場上有競爭力的核心技術太少。大部分高校和科研單位做的都是和企業壹樣水平的研發，距離並沒有拉開。根據創新體系中的合理分工，國家科研機構不應與企業爭奪“市場”，而應退出企業能做的技術研究。科研單位要強調科研成果的輻射作用，而不是壹般的成果轉化。
國內還有壹種輿論認為應用不是核心技術。只要掌握了所謂的核心技術，應用自然會發展起來。這種思想表現在不註重高新技術研究的戰略應用，而是追求單項技術的高指標。在科研上，以“與熊掰棒子”、“磨刀不誤砍柴工”的方式不斷研究所謂的“尖端”技術。核心技術的突破不是少數科研人員關起門來就能攻克的，必須被用戶持續使用，並根據他們的反饋進行改進，才能成為真正有競爭力的產品。從這個意義上說，核心技術是用出來的，有競爭力的國貨是用戶培養出來的。要高度重視從應用中發現科技問題，以需求引領科研，以應用帶動核心技術突破。無論科研、開發還是行業規劃，都要緊緊圍繞需求目標。
除了重視以自主技術為基礎的高新技術產業，中國還非常重視引進和開放技術的消化、吸收和提高。要大力加強消化和改進引進技術的投入，不能甘於長期做外國產品的傾銷地和試驗場，也不能天真地等待外資企業的所謂“外溢”好處。