腎囊腫多為良性腫瘤，壹般不會癌變，但不能排除癌變的可能，需要定期檢查。
而且腎囊腫如果繼續生長，可以持續壓迫器官周圍的細胞，導致器官功能異常。此時需要治療，否則腎功能受損，最終發展為腎衰竭和尿毒癥，嚴重影響生活或危及生命。
腎囊腫的傳統手術方法包括細針穿刺和開放手術。前者在b超引導下用長穿刺針從皮膚穿刺囊腫吸出囊液，避免了手術的痛苦，但穿刺後容易復發。後者雖然復發率低，但患者傷勢較重，腰上有很長的手術疤痕。
目前腎囊腫的最新治療方法:微量中藥滲透療法。這種療法在治療腎囊腫的許多臨床病例中取得了良好的效果。該技術是經過高科技技術治療的多囊腎病的有效中藥。顯微治療後具有很強的生物活性，靶向定位，靶向治療囊腫病變。此療法有以下兩種治療作用:壹是擴張多囊腎周圍血管壁上的血管，加速囊壁血液循環，促進囊壁通透性增加；促進囊壁血壓下降；逆轉了壓差，因為血管壓力高於膠囊壓力；它加速了囊液中的水分持續重吸收到血管中。其次，中藥活性物質微粉化抑制了囊壁上皮細胞的持續分泌；它可以防止囊壁中的血管和囊腫擴張。
通過上述治療措施，微中草藥活性物質的治療改善了血管壁和囊腫的循環障礙，軟化了囊壁，增加了囊壁的外通透性，抑制了囊壁內細胞的分泌。
即使腎囊腫壹般不會癌變，但仍有癌變的可能。為了不加重病情，提醒患者註意定期體檢，以便早發現病情變化，早治療。