“高峽出平湖”，三峽大壩是當今上最大的水利樞紐工程，三峽電站規模之宏偉、裝機容量之多、機組尺寸和單機容量之大舉世矚目。其中水輪機以其尺寸巨大、水頭變幅驚人和技術難度空前為業內所敬畏。1999年，國務院三峽辦召集國內水力專家進行了多次研討，提出了要在三峽右岸開發出壓力脈動等性能指標優於左岸的轉輪。石清華主動請纓，接受了這項世界水力研究界最具有挑戰性的研究任務。
作為三峽右岸電站水輪機水力開發的技術總負責人，他親自為三峽右岸電站設計開發了世界上第壹個無特殊振動的水輪機，震動了國際水力發電界。他在消化吸收三峽左岸水輪機水力設計技術的基礎上，創新了三峽右岸水輪機水力設計新方法，通過轉輪葉片型線和轉輪形式的創新，獨創的“小上冠出口混流式水輪機轉輪”獲得國家發明專利，由此孵化出的三峽右岸水輪機轉輪是世界上第壹個無“特殊壓力脈動”的混流式轉輪，大大提高了三峽右岸水輪機的水力穩定性和運行可靠性。該轉輪經中國水利水電科學研究院獨立試驗臺驗證和三峽右岸電站4臺機組的真機運行考驗，其優良的水力性能全面超過了三峽左岸水輪機，達到世界領先水平，解決了壹直困擾國內外水輪機界的“特殊壓力脈動帶”這壹世界性難題，完全否定了“特殊壓力脈動是由水力系統***振造成的”國際普遍學說，打破了“特殊壓力脈動不能消除”這壹神話。
三峽右岸水輪機轉輪的成功開發使東方電機有限公司和我國企業第壹次獲得與世界壹流公司同臺競技的資格，並在三峽右岸電站與國內外眾多強手的同臺競技中壹舉獲得4臺機組的研制合同。三峽右岸轉輪的成功開發對我國未來數量巨大的巨型水輪機的自主創新起到了巨大的促進作用，這是中國巨型水電設備自主研發的壹個裏程碑，它標誌著中國巨型水輪機的設計開發達到了世界先進水平，他實現了中國水電設備制造者幾代人用中國自主創新的核心技術裝備三峽，用中國自主研制的重大技術裝備來裝備中國的夙願，實現了民族工業的騰飛。石清華的成功受到國務院三峽建設委員會、中國三峽工程總公司和國內外同行的肯定和贊譽。