以水產特色學科為重點的農業部重點大學，農、理、工、經、文、管學科協調發展。
上海水產大學是壹所具有95年悠久歷史和光榮傳統的普通高等學府。其前身是成立於1912的江蘇省水產學校。1952成為全國第壹所本科水產大學——上海水產學院。1985更名為上海水產大學。2000年起，由農業部和上海市共建，屬地管理。現在學校已經發展成為壹所教育體系完整、學科眾多、辦學特色鮮明、農、理、工、經、文、管協調發展的多學科大學。
學校設有生命學院、海洋學院、食品學院、經濟與管理學院、信息學院、人文學院、工程學院、外國語學院等八個專業學院，以及國際文化交流學院、成人教育學院、高職學院、愛恩學院等四個學院，由我校與澳洲合作辦學。還設有中央農業幹部教育培訓中心、上海水產大學分校和農業部海洋漁業培訓中心。
擁有1個國家級重點學科、7個省部級重點學科、4個上海教育高地和1個上海高校E研究所。現有博士後科研流動站1個，壹級學科博士學位授權點1個，二級學科博士學位授權點6個，壹級學科碩士學位授權點1個，二級學科碩士學位授權點26個，同等學力碩士學位申請點7個，本科專業33個(含6個國家管理類專業)和壹批高職專業。
學校現有本科生12700余人，研究生790余人。學校現有教職工近1，000人，其中專任教師780余人，高級專業技術人員350余人，博士、碩士研究生導師271人。學校擁有國務院學位委員會學科評估組成員1人，國家百千萬人才工程成員1人，國家級有突出貢獻中青年專家2人，省部級有突出貢獻中青年專家3人，農業部第七屆科學技術委員會委員4人。
學校辦學條件優越，教學實驗室和專業實驗室設施齊全。擁有教育部水產種質資源創新與利用重點實驗室、農業部水產種質資源與養殖生態學重點開放實驗室、農業部水生生物病源庫和冷藏檢測中心；建立了壹批專業實驗室，如中美(SFU-NOAA)海洋遙感與漁業信息研究中心和淡水漁業加工利用研究室。擁有中國漁業發展戰略研究中心和7個校級研究中心，建立了上海水產大學農業研究所、公共管理研究所、中國魚文化研究所、外語研究所、中國魚文化博物館。擁有國內外知名的魚類研究室和標本室，亞洲最大的專業鯨魚博物館。圖書館藏書77萬冊，電子書38萬冊，以水產、海洋、美食為特色。擁有現代化的校園網，建成了服務中國水產行業的“中國水產網”網站平臺。我校主辦的《中國水產報》、《上海水產大學學報》被列為中文核心期刊、中國科技核心期刊和中國科技論文統計源期刊，《中國水產報》獲第壹、二屆“全國百篇優秀學術期刊”稱號。學校還隸屬於上海市漁業學會、上海市漁業經濟研究會、上海市延安精神研究會。
90年代以來，學校60余項科技成果達到國際領先和先進水平，90余項國內首創和先進，40余項獲國家科研項目或成果獎，50余項獲省部級獎勵，30余項獲專利。我校在環境保護、物種保護、遺傳育種、食品加工、海洋資源開發利用、水產養殖、農業經濟等領域做出了巨大貢獻。2006年科研經費達到4200萬元。
學校與美國、日本、俄羅斯、澳大利亞等國家的大學以及多個國際組織有著密切的交流與合作，與多所國外大學互派留學生，長期參與中美海洋生物資源合作計劃，與聯合國糧農組織、聯合國教科文組織、漁業信息中心、亞洲漁業學會、國際水生生物資源管理中心等國際組織建立了長期友好合作關系。
學校目前擁有楊浦區龔俊路校區和南匯區雪海路校區兩個校區，並在浙江南匯、奉化、象山縣設有三個養殖基地。根據上海市高校結構調整計劃，我校將於2008年搬遷至上海臨港新城。新校區位於臨港新城主城區，規劃面積約1.600畝，規劃建築面積58.6萬平方米。在不久的將來，壹所功能齊全、設施先進、環境優美的現代化大學將矗立在東海之濱、滴水湖畔。
為適應我國高等教育大眾化趨勢，促進水產、海洋科技和高等教育的發展，培養適應社會需要和地方經濟社會發展迫切需要的專業人才，學校提出了新時期的辦學目標:力爭2012，到建校百年時，把學校建設成為農、理、工、經、文、管協調發展的水產、海洋、食品優勢明顯的學科。在國際上具有重要影響的高水平特色大學，成為培養高層次專業技術人才和高素質應用型人才的搖籃，我國水產、海洋、食品科技創新的重要基地。