西紅柿灰黴病各地抗性不壹樣，建2113議咯菌腈或者異菌脲或者木黴菌或者腐黴利或5261者丁子香酚或者啶酰菌胺等交替使用農藥成分。
隨著溫度的下降，大棚蔬菜如番茄、黃瓜等很容易發生灰黴病，在露天條件下很少發生。很多地區灰黴病暴發起來很難控制，灰黴病多從果柄上染病，果實感染上灰黴病導致果實腐爛，灰黴病的初次侵染多來自土壤，也屬於土傳病害。
但是灰黴病有其自身的特規律，病菌發病的適宜溫度為18-23℃，低溫度為4℃，高溫度為32℃，低於8℃、30℃難以發病。花期是病菌侵染高峰期，果實膨大期巧用速藤肥 提高番茄產量是發病高峰期。殘留的柱頭或花瓣多先被浸染，後向果柄或果面擴展，果實被害，病部變軟，腐爛，導致產量的直接損失。
操作上要註意：
1、利用溫室封閉的特點，創造高溫、低濕的生態環境。溫室夜間濕度多90%，清晨拉苫後，要隨即開啟通風口，通風排濕，降低室內溫度，並以較低溫度控制病害發展。9：00後室內溫度上升加速時，關閉通風口，使室內溫度快速提升至35℃，以高溫降低室內空氣濕度，控制該病發生。14：00以後逐漸加大通風口，加速排濕；蓋苫前，只要室溫不低於16℃，要盡量開大風口。
2、及時清除病花、病葉，很多農戶用激素蘸花，花瓣容易粘在果柄上，果柄是很脆弱的地方。在棚內濕度大時候，水滴、霧滴等也容易滴在果柄上，所以灰黴病很多在果柄上表現出來。
3、灰黴病病菌在有糖分的時候孢子繁殖快，西紅柿轉色的時候就是糖度增加的時候，這個時候容易感染灰黴病，也是用藥的關鍵時機。此期提前用青枯立克+地力旺噴霧，病害高發時候可以復配大蒜油、化學藥等。