廣珠鐵路因珠海、江門、新會、鶴山、廣鐵集團五家股東全部資金不足，於1999停運。隨著經濟的發展，珠海和江門越來越感到沒有鐵路的痛苦，很多機會因為沒有鐵路而錯過。珠海、江門、新會的人大代表多次提出議案，要求他們復工。
2004年，鐵道部決定入股廣珠鐵路。鐵道部部長劉誌軍說:“廣東鐵路嚴重缺人，廣珠鐵路效益肯定好。”2004年底，廣東的交通仍然過於依賴高速公路。廣東鐵路總裏程僅為1883公裏，占全國營業總裏程的2.56%，排名全國倒數第四。廣東省常務副省長鐘陽勝說:“這與廣東GDP占全國近10%的地位不相適應。珠江口西岸至今還是鐵路空白，壹定程度上影響了這些地區的工業化和城市化進程。”張德江出任廣東省委書記後，敏銳地意識到廣東鐵路嚴重不能滿足經濟社會發展的需要，僅靠廣東自身力量難以建成四通八達的鐵路網。2003年，張德江書記與鐵道部部長劉誌軍就加快廣東鐵路建設進行會談。2004年6月65438+10月1日，雙方簽署《鐵道部與廣東省人民政府關於加快廣東省鐵路建設的會談紀要》，省直部門共建廣珠鐵路等9條鐵路。2005年初，張德江書記與劉誌軍部長再次會談，對進壹步推進廣東鐵路建設作出部署。廣珠鐵路被列為省部合作優先發展的七條鐵路之壹。
很快廣珠鐵路重新確定了出資方和持股比例:鐵道部出資40%，廣東省出資25%，珠海市出資30%，江門出資5%。廣珠鐵路從地方鐵路變成了鐵道部主導的合資鐵路。當時廣東省下定決心在2005年開工建設。然而，事情並沒有想象的那麽簡單。首先，廣珠鐵路原本只有環評大綱，但新要求要求環評，並通過了國家環保局的審查。還增加了土地預審環節。另外，按照原來的線，很難繼續，線位也要重新設計。諸如此類，廣珠鐵路的建設工期將會推遲。廣珠鐵路壹直備受爭議，“廣珠鐵路沒有貨運量”的聲音不絕於耳。對此，珠海壹直認為，珠三角是中國經濟最發達的地區之壹，每年都有兩位數的經濟增長，車流量與交通線的網絡化有關。目前珠三角東部的廣深有四條平行線，還有廣深港高鐵和東南沿海鐵路。顯然，珠三角東部的鐵路拉動了東部經濟的發展。路越多，貨運越多，很快就會達到飽和，促使東部不斷增加“動脈”。
研究表明，工業產值每增加1%，鐵路貨運量就會增加0.5%。2006年珠海工業總產值比2003年翻了壹番多，達到2050億元。沿線的江門、新會也經歷了快速增長。鐵道第四勘察設計院2003年對廣珠鐵路項目進行了重新評估，預測廣珠鐵路正線(不含珠海臨港工業區)客貨運量分別為201176萬人和1538萬噸。珠海對廣珠鐵路所需貨物的供應很有信心:鐵路樞紐靠近珠海高欄港和新會臨港工業區，其中高欄港2010貨物吞吐量近2000萬噸，70%的貨物需要北上。這還不包括這兩個臨港工業區及周邊地區的工業產品和原材料。廣珠鐵路項目公司今天掛牌，意味著廣珠鐵路即將復工。但廣珠鐵路的走向和終點站都變了，原設計中的客運也改成了貨運。這條20年前開工建設的鐵路，歷經曲折和爭議，如今有望填補上珠江口西岸鐵路的空白。“火車壹響，黃金萬兩”，珠三角西部渴望鐵路拉動。
避開了市區，航站樓也按照原來的規劃設計進行了改動。廣珠鐵路北起廣州三眼橋火車站，通過廣州鐵路樞紐與京廣、廣深、廣茂、廣梅汕鐵路相連。幹線經佛山、南海、順德、鶴山、江門、新會至珠海鬥門區，全長140公裏，支線到達高欄港，約33.8公裏。新廣珠鐵路不再貫穿大佛山中心，從廣州江村與京廣鐵路相接，沿佛山西向南，在三水附近與廣茂鐵路相交，經丹竈穿越佛開高速公路進入江門，在新會龜峰山景區改為8公裏隧道穿越，保護景區。然後，鐵路越過虎跳門，進入鬥門，沿黃茅沿海直入珠海高欄港，全長約180公裏。高欄港從原來的支線站變成了幹線碼頭。
珠海市政府副秘書長陸表示，廣珠鐵路1985設計至今已有20多年，珠三角經濟和城市發展發生了巨大變化。按照原來的路線，廣珠鐵路實際上不可能經過佛山、順德、南海的市區、工業區、高新區，而且征地費會很貴。廣珠鐵路新設計更具可操作性，避免了原設計中三眼橋的瓶頸。將原珠海西站改為高欄港，更有利於珠海高欄港的發展。
貨運為主，長期客運為主廣珠鐵路原來以客運為主，兼顧貨運，所以終點站在珠海大橋下的賀州北，在鬥門小池坎接壹條支線到高欄港。由於廣珠城鐵已經開工，所以廣珠鐵路經過“改裝”，以貨運為主，遠期兼顧客運。高欄港自然成了碼頭。盧說:“目前，中國的鐵路幹線樞紐不多。高欄支線改造成幹線，不僅為珠海減少了4億元的投資，也意味著物流環境發生了變化。這不僅有利於珠海港，也有利於江門、新會港及附近珠三角西部的貨物吞吐量。因為，到目前為止，珠三角西部還沒有鐵路。”
中化格力港口、中化格力倉儲有限公司董事總經理牟翔峰聽到這個消息非常高興。2005年，世界500強企業中化集團與格力集團共同投資2.2億元人民幣，在高欄港南京灣建設兩個8萬噸級石化公用碼頭，雙方還共同投資3億元人民幣，在高欄港鐵爐灣建設壹個總庫容44萬立方米的燃料油、成品油和大宗石化產品的罐區。牟翔峰說:“沒有這條鐵路，我們很多大生意都做不起來。現在，當客戶知道妳有權限時，他們就會來了。我們中化對這條鐵路很期待。”廣珠鐵路建設已經完成，監理招標已獲鐵道部批準。中鐵六局集團有限公司將建設包括虎跳門大橋在內的相關項目。廣珠鐵路將以貨運為主，在佛山設官窯、丹竈、西樵三個車站。此外，還將在廣廣鐵路交匯的新三水段預留壹個客運站。
廣珠鐵路初步設計方案已獲鐵道部批準，全長189.4公裏，預計總投資1.31.6億元，建設期約4年。廣珠鐵路北端在廣州江村編組站與京廣鐵路相接，南至珠海高欄港。全線共分五段，每段包含壹個主要控制性工程，分別為白坭河大橋、江北大橋、西江大橋、江門隧道、虎跳門大橋。其中虎跳門大橋和江門隧道為全線控制性工程，確定為首批建設項目。
根據初步設計方案，廣珠鐵路擬以貨運為主，設江村、大田、官窯、丹竈、鶴山、江門南、顧靖、鬥門、珠海西、高欄港***10車站，其中江村編組站至江門南站(含)、江門南站至高欄港站。另外會在佛山。2011 4月19日，廣珠鐵路控制性工程虎跳門特大橋主跨248米順利合龍。虎跳門大橋連續梁是廣珠鐵路五大控制性工程之壹，耗時最長，技術最復雜。它的如期順利合龍，為廣珠鐵路2011年底通車奠定了良好的基礎。
2012年6月，廣珠鐵路1江村編組站下遊始發站工程已全面鋪開。廣珠鐵路連接京廣線的控制性工程進展順利。
2065438+2002年7月，廣珠鐵路開始大規模接觸網格線，進度近半。廣州、佛山、江門、珠海等地已架設接觸網，預計9月底全線貫通。