功能糖是壹類具有特殊功能的碳水化合物，主要包括功能性低聚糖、功能性膳食纖維和功能性糖醇。由於功能糖的特殊功效，可以作為功能性成分添加到食品中，也可以作為食品中蔗糖的替代原料，減少食品中糖對特殊人群的影響。從純化學的角度來看，功能糖其實是指功能性低聚糖、功能性膳食纖維、功能性糖醇等具有特殊生理作用的物質。
功能糖包括功能性低聚糖、功能性膳食纖維和功能性糖醇。其中，功能性低聚糖是指對人體健康有壹定改善作用的功能性糖類，多為2 ~ 10個單糖通過糖苷鍵連接而成的低度聚合糖。不是所有的低聚糖都變成功能糖。低聚糖只有不被人體胃腸道消化吸收，直接進入大腸被雙歧桿菌利用時，才被稱為功能性糖。因為人體腸道內沒有水解它們(異麥芽酮糖除外)的酶系統，所以它們不被消化吸收而是直接進入大腸。
這種特性使它們優先被雙歧桿菌利用，它們是腸道有益菌的增殖因子，也稱為益生元。這些功能糖主要包括低聚木糖(木寡糖)、低聚果糖(低聚果糖)、水蘇糖、低聚半乳糖、低聚異麥芽糖、大豆低聚糖等。功能糖多為玉米芯、甘蔗渣、麥稭等富含半纖維素的物質經酸法、酸酶法或酶法制成的糖，如低聚木糖；或者由壹些澱粉糖經酸法、酸酶法或酶法制成的糖，如低聚異麥芽糖。功能糖是近年來出現的新詞匯。最早從日本傳入中國，國家大力扶持和推廣功能糖。
據智研數據研究中心分析，含低聚果糖的食品在上世紀90年代初開始投放市場。目前國內低聚果糖生產企業約8家，總產能約1.5萬t，其中保齡寶生物有限公司和廣東江門量子高科生物有限公司是國內生產低聚果糖的主要公司，其低聚果糖的市場份額達到70%以上。雲南天元保健食品有限公司年生產能力3000t；張家港良豐1000t。
低聚木糖:2009年全球低聚木糖市場容量約為654.38+0.5萬t，增長迅速。目前全球低聚木糖產能只有5000多t，市場缺口很大。
大豆低聚糖:大豆是我國主要農作物之壹，我國大豆產量居世界前列，僅次於美國和巴西。大豆低聚糖是直接從大豆分離蛋白和大豆乳清中提取的天然低聚糖。目前，我國大豆低聚糖產量僅次於美國位居世界第二，年產量接近1000t，日本、美國和歐洲是我國大豆低聚糖的主要出口國。由於價格關系，大豆低聚糖國內銷售較少，大部分產品用於出口。
海藻糖:海藻糖味道很甜，可以作為食品的天然甜味劑。
20世紀90年代末，日本和中國研究人員分別發明了“澱粉雙酶法生產海藻糖新工藝”，使海藻糖這種新型功能性低聚糖得以產業化。
目前海藻糖實際年產量已超過8萬t，世界市場對海藻糖的實際需求量達到654.38+0.5萬t，市場缺口較大。日本和中國都是世界上海藻糖的生產國，海藻糖的應用已經擴展到生化制劑(微生物制劑)、藥物制劑、化妝品、農業科學等學科，應用範圍非常廣泛。