職能:綜合協調各部門工作；主持會員代表大會、理事會等重要會議；制定協會年度、月度工作計劃和年度、月度總結；負責管理協會的人事和勞動工作；負責協會印章、公文、檔案、後勤管理；負責處理來信來訪，管理與上級部門和兄弟單位的業務往來；負責會員註冊、認證、備案和會員名單管理；管理協會的其他全面工作。
中小企業服務中心
職能:負責貫徹國家、省、市有關中小企業發展的法律、法規和方針政策；負責調查中小企業經濟運行情況，向主管部門提出合理化建設建議；接受中小企業的投訴，盡壹切可能協助處理；負責組織各種有針對性的活動(每月至少兩次)，促進中小企業之間的交流與合作；負責推進融資擔保體系建設，不斷拓寬中小企業投融資渠道；負責與中國中小企業協會及相關機構的聯絡、交流與合作。負責中小企業工作委員會的日常工作和協會交辦的其他工作。
雇主的工作部門
職能:負責市縣雇主組織的建立和雇主工作業務的指導；負責本協會雇主工作委員會的日常工作；負責本協會維權委員會的日常工作；參加我省協調勞動關系三方會議，代表協會參加勞動仲裁；承辦或召集成員單位參與省人大和省政府委托的法規草案修改工作，並就修改意見作出書面報告；收集企業和企業家對政府工作的意見和建議，及時傳達給有關單位和領導；做好企業和企業家的維權工作；為會員單位提供免費法律咨詢，有償承接企業法律委托。負責本協會的所有法律事務。負責與中企聯雇主工作部及其他對口部門的聯系，負責對口業務的辦理。
研究和規劃部
函數:1。負責本省企業科學發展和企業家隊伍建設的研究工作，以及本協會發展方向的研究工作。2.利用客座研究員和專家組成的研究團隊，為企業提供業務指導和智力服務。3.負責海南省100強企業排名和海南省年度企業發展報告的編輯出版工作；4、負責組織每兩年評選表彰優秀企業和優秀企業家等相關活動的策劃；5、收集國內外先進企業管理成果，結合本省實際開展宣傳活動，並組織企業開展多種形式的學術活動；6、負責與研究部、咨詢中心等對口單位的聯系並負責辦理對口業務。
公共關系部
職能:負責協會與國內外有關單位的聯絡，開展經濟、科技、文化交流與合作活動；負責組織國內外考察、觀光和商務活動；與國外5-10相關機構建立相對固定的交流合作關系。負責接待國內外來訪代表團，開辟廣泛的業務合作渠道；負責與中國企業國際聯絡部培訓中心、省外辦、臺辦等相關單位的聯系，負責對口業務的辦理；負責開展各種形式的職業素質培訓課程，如自辦、合辦或代課培訓等。
培訓部(工作處理部)
職能:負責組織職業經理人的培訓和認證；負責與中國企業協會職業經理人認證辦公室、省行政學院等相關單位的聯系與合作；負責其他專業技術素質培訓業務；做協會交辦的其他工作。
項目信息部
職能:負責項目信息的收集、登記、分析和管理；負責實施有償中介服務項目；負責組織會員企業和各單位、場所的信息交流活動；負責協調本協會下屬公司和機構的工作。
會員發展部
職能:負責項目信息的收集、登記、分析和管理；負責實施有償中介服務項目；負責組織會員企業和各單位、場所的信息交流活動；負責協調本協會下屬公司和機構的工作。
海南企業家報
職能:編輯發布《海南企業家》；定期發布協會主要工作動態信息；負責協會在報紙上的宣傳；發布會員單位信息，承辦報刊宣傳業務；負責與省委宣傳部新聞辦、省文體廳報社和各新聞單位的聯絡工作；反映會員和會員公司的聲音，做好輿論引導。
現代管理培訓項目
職能:制定海南省現代管理領域培訓的具體實施方案和任務計劃；向中國企業聯合會工程辦公室推薦現代管理領域“653工程”教學基地；協助中國企業聯合會工程辦公室對教學基地進行指導和管理；參與相關教師的選拔、資格認定、培訓和評估；參與協助組織招聘、培訓及相關工作，監督檢查教學基地的教學工作，確保教學質量；根據要求，組織推薦優秀教學基地、優秀教師和優秀組織者；參加中國企業聯合會工程辦公室和海南省人事勞動保障廳相關部門的專題會議或相關活動；及時總結並定期向中國企業聯合會工程辦公室和海南省人事勞動保障廳相關部門報告工作進展情況。
國際培訓部
職能:國際培訓部負責行業對外交流與培訓、留學移民合作項目、海南酒店業酒店管理與外語培訓項目。最近，馬耳他推出了永久居留服務，以滿足海南企業家的需求。
雇主工作委員會
海南省企業家協會雇主工作委員會的工作任務和職責
壹.任務
1.認真貫徹黨的方針政策，探索市場經濟條件下大特區雇主組織工作的運行管理機制和內在規律；
2.積極參與由政府勞動部門、工會和企業家協會組成的三方協商機制，以調解、仲裁等方式及時、公正、合理地處理和協調勞動關系中的各類問題，維護企業和企業家的合法權益；
3.加強與國內外協會和國內外雇主組織的聯系和交流，接受國家有關部門的委托，接受國外協會和企業的邀請，派會員出國進行經濟考察、學術研討和雇主工作交流。
第二，責任
1.認真貫徹執行董事會和行長辦公會議關於雇主組織工作的會議精神，負責向董事會和行長辦公會議匯報雇主組織工作的落實情況；
2.負責制定用人單位的工作計劃，討論各項提案，確定內部辦公室及相關人員設置方案；
3.負責集體談判規則、勞動合同法、就業保障法等我國勞動立法法規草案的修改和咨詢；
4.負責安排參加國際勞工組織的各種會議。代表用人單位參與處理各種勞動關系爭議；
5.負責組織用人單位舉辦各類培訓班、講習班和專題講座，總結推廣經驗。負責發布相關信息；
6、負責加強與政府勞動部門、工會的聯系，理順關系，廣泛合作交流，推動工作，提高工作效率；
7、負責向中國企業協會、省政府及相關部門和其他主管部門匯報工作和請示。
女企業家工作委員會
海南省企業家協會女企業家工作委員會的任務和職責
壹、主要任務
1.認真貫徹黨的方針政策，積極探索小政府大社會的運行管理機制和內在規律，探索特區企業和女企業家的工作思路，為海南政治經濟體制改革建言獻策和實踐探索；
2.與省級婦聯等相關婦女組織合作，圍繞女企業家的所思所想和需求，積極向政府和職能部門反映女企業家的聲音，發揮政府與企業之間的橋梁作用；
3.積極引導女企業家加強企業文化建設，培養企業家精神，重視女企業家文化的研究；
4.反映情況，主持正義，維護女企業家的合法權益。
二、主要工作職責
1.執行董事會和總裁辦公會議的有關決定和決議，討論女企業家的各項提案和主要工作計劃，決定內部辦公室和有關人員設置方案；
2、負責與全國女企業家組織的橫向聯系，定期或不定期為女企業家舉辦各種經濟、文化、物資和信息交流活動，開展各種文化娛樂活動；召開各類社會晚會、涉企新聞發布會、評優評選會，為女企業家舉辦各種形式的講習班、培訓班、專題講座；
3.提高女企業家素質，負責培養女企業家，評選獎勵女企業家中的先進代表；積極在女企業家中選拔優秀人才，推薦到各級相關部門掛職或掛職鍛煉；
4.負責與雇主工作委員會合作，在女企業家中組織雇主。