從2007年開始，杭州華東制藥集團有限公司適應時代，在人、財、物等方面進行改革，根據市場要求調整產品結構。註重生產、營銷、科研、管理的全面發展，人與企業和諧相處。4月，開展了以“解放思想、轉變觀念、破除迷信、提高認識”為核心的整改，促進華東制藥集團持續快速發展。
華東制藥集團成為2004年至2006年“工業興市”功勛企業，連續三年獲得杭州市“十大突出貢獻工業企業”稱號，2006年、2007年獲得杭州市“工業興市”稱號。2008年，集團再次榮獲杭州市“工業興市功勛企業”稱號，集團董事長李邦良榮獲杭州市“工業興市功勛企業優秀經營者”稱號。
華東制藥集團位列中國制造業企業500強。自2005年中國企業家協會、中國企業家協會發布中國制造業企業500強名單以來，華東制藥集團年年上榜。2008年，參照國際慣例，中國企業家聯合會、中國企業家協會以2007年企業銷售收入達到30億元為入圍標準，第四次評選中國制造業500強，並獲得專家委員會認可。華東制藥集團榜上有名，排名第363位。
東方華誼制藥有限公司壹期工程竣工。埃斯特維華誼制藥有限公司是杭州華東制藥集團有限公司下屬企業，位於浙江紹興袍江工業園區，主要從事仿制藥原料的研發、生產和銷售。占地面積654.38+0.32萬平方米，壹期用地8萬平方米。總投資4600萬美元，註冊資本17萬美元。2008年3月，公司主體工程壹期竣工，整個項目計劃於2009年底竣工投入使用。
4月，華東制藥集團第壹大成員華東制藥有限公司出資9800萬元收購公司持有的Xi安博華藥業有限公司78.87%的股權和陜西九洲藥業有限公司65%的股權。本次並購是華東制藥公司調整產品結構，加快部分原料藥和化工中間體戰略布局調整的舉措，符合開拓國際市場的需要，有助於在特色原料藥(婦科用藥)和麻醉藥領域實現新的拓展。
新藥開發華東制藥集團堅持原料與制劑、國際市場與國內市場、技術與管理並重的原則，堅持聚焦壹個產業，不斷開發新產品，鞏固和擴大國內市場，開拓和融入國際市場。9月，華東制藥集團生物工程研究所新研發的免疫抑制劑產品他克莫司GMP管理流程正式通過美國FDA現場檢查，順利獲得原料藥和制劑生產批文，從而獲得產品打開美國市場的準入保護。8月，康潤制藥有限公司獲得骨傷藥舒靜活血膠囊的生產許可。5438年6月+2月，杭州九元基因工程有限公司的第壹個化學藥——鹽酸潘諾司瓊止吐藥正式上市。
6家企業成為國家高新技術企業。2008年，杭州中美華東制藥有限公司、杭州九元基因工程有限公司、浙江華誼藥業有限公司、華東醫藥集團生物工程研究院有限公司、杭州助養心藥業有限公司、華東醫藥集團康潤制藥有限公司6家成員企業通過了科技部評定的國家高新技術企業認定。