由於時間和意外，存放阿爾瑪屍體的實驗艙發生泄漏。由於阿爾瑪的偉大精神，在她死後，變成了對ATC公司的強大怨恨，折磨著她。這種怨恨以精神的形式從泄露的實驗艙中逃逸出來，激活並釋放了她的“兒子”之壹帕克斯頓，通過帕克斯頓控制的ATC克隆人軍隊實現了她對ATC和世界的復仇。
在空管連血洗後，政府派出了油氣炸彈小組和輔助三角洲部隊來處理這起被定義為恐怖襲擊的事件，而阿爾瑪的另壹個“兒子”，我們的主角，被派往前線作為油氣炸彈的壹員
個人認為ATC的影響力還是很強的，可能已經滲透到政府內部了。這次行動中派出與阿爾瑪有關的主角，並不是偶然的，而是針對他們制造和訓練的超級戰士的壹次實戰數據收集行動。在後面的資料片珀爾修斯指令中我們可以看到，擁有時間減速能力的F.E.A.R成員不止壹個，可以推斷這種能力已經量產。
因為主角是阿爾瑪的親生兒子，所以妳可以發現遊戲中阿爾瑪的出現並不會主動攻擊主角，只會嚇嚇妳。