信陽高新技術產業開發區管委會下設辦公室、招商局、建設局、財政局、規劃局、國土局、工商局、國稅局、地稅局、經貿發展局、社會局、行政執法局等十二個部門，下轄東辦事處。
信陽高新技術產業開發區著力打造特色產業園區，重點打造以航天特種車輛、航天高端緊固件為主的航天產業園；依托茶業區，重點建設信陽毛尖和“信陽紅”茶葉產業園；依托華意開關、新店電器、萬泰電器，重點打造電器產業園；以萬華板材產業為依托，重點打造生態板材產業裝備R&D和制造產業園；依托京珠物流走廊，著力建設現代物流園區；依托東部地區小企業集群，重點建設小企業孵化產業園；依托泛藍電子、東信藍光、天陽液晶、博士達通信等高科技電子項目，著力打造河南最大的、在華中地區具有戰略地位的電子產業基地。