公司回購股份所有權的確認方法:公司因減少註冊資本、公司合並等原因回購股份的。，回購的股份歸公司所有；如果是因為員工持股計劃或者股權激勵而回購的，回購的股權以後歸員工所有。
法律客觀性:
中華人民共和國公司法
第178條
有限責任公司增加註冊資本時，股東認繳新增資本的出資，依照本法關於有限責任公司出資的有關規定執行。股份有限公司發行新股增加註冊資本時，股東認購新股，依照本法設立股份有限公司繳納股款的有關規定執行。
公司法
第178條
有限責任公司增加註冊資本時，股東認繳新增資本的出資，依照本法關於有限責任公司出資的有關規定執行。股份有限公司發行新股增加註冊資本時，股東認購新股，依照本法設立股份有限公司繳納股款的有關規定執行。