九洲藥業研發中心是省級高新技術研究開發中心（全稱為“九洲新藥省級高新技術企業研究開發中心”），在臺州、杭州分別設有研究所，建有兩個研發專用中試車間，於2008年成為國家級博士後科研工作站，中心是壹個功能齊全的現代化高新技術研發中心，設有多間標準實驗室，擁有核磁***振、液質等高端檢測設備，有按歐美大型制藥公司標準設計建造的實驗工作臺，研發設備涵蓋化學藥物、生物藥物、制劑等多個方向。 中心現有研發人員200多人，有“浙江省海外高層次人才計劃”領軍人物，具有博士學位的8人、碩士學位30多人，85%以上具有大學以上學歷，多人具有歐美等發達國家留學及工作經歷。中心與中科院、清華大學、浙江大學、南開大學、浙江工業大學、上海交大等國內知名院校和科研機構有著廣泛深入的合作。 中心致力於新藥及制藥新技術的研究，每年投入大量的資金用於研究開發，構建了完善的研發創新體系和考核獎勵制度。近幾年來，公司每年研發項目達60余項，在產品開發和技術創新方面均取得了突出的成績，並得到了國家各級有關部門的肯定，在研發中心成果的基礎上，九洲藥業於2009年被認定為浙江省創新型試點企業，2010年被認定為浙江省專利示範企業，2011年被認定為浙江省重點創新團隊。