如果是國內企業個人轉讓給國外，沒有作備案的話合同沒有生效。
如果妳們不是國內企業個人轉讓給國外，合同自成立起生效：
合同生效和專利權轉讓生效是2件事。因為沒備案專利仍在原權利人手中；但即使沒備案合同仍然有效。
如果雙方沒有異議補做備案就行了；如果對方有異議就去法院告對方要求確認合同有效，然後等法院判決勝訴了要求法院出協助執行通知給專利局。