它驗證空間站建造和運營所需的最後幾項關鍵技術，為中國建造“天宮”打下重要基石。
神舟十三號飛船是中國空間站轉入建造階段前發射的最後壹艘飛船，自有其“神奇”和“獨特”之處。徑向交會對接和180天在軌飛行是實現中國空間站多人同時值守和長期有人照料的關鍵，只有掌握它們，中國才能擁有壹個堅不可摧的“天宮”。
神舟十三號飛船要驗證的另壹項關鍵技術是6個月長期在軌飛行，這將創下中國航天員最長太空駐留紀錄。
主要目的：
壹是開展機械臂輔助艙段轉位、手控遙操作等空間站組裝建造關鍵技術試驗。
二是進行2—3次出艙活動，安裝大小機械臂雙臂組合轉接件及懸掛裝置，為後續空間站建造任務做準備。
三是進壹步驗證航天員在軌駐留6個月的健康、生活和工作保障技術。
四是進行航天醫學、微重力物理領域等科學技術試驗與應用，開展多樣化科普教育活動。
五是全面考核工程各系統執行空間站任務的功能性能，以及系統間的匹配性。