我國《專利法》保護的是本法所稱的發明創造是指發明、實用新型和外觀設計。依據專利法，發明專利申請的審批程序分為受理、初審、公布、實質審查和授權五個階段。
發明，是指對產品、方法或者其改進所提出的新的技術方案。
實用新型，是指對產品的形狀、構造或者其結合所提出的適於實用的新的技術方案。
外觀設計，是指對產品的形狀、圖案或者其結合以及色彩與形狀、圖案的結合所作出的富有美感並適於工業應用的新設計。
我們在實際生活中所說的祖傳秘方通常指配方或制作工藝，也有可能是疾病的診斷和治療方法。如果是配方或制作工藝，這種只能申請發明專利。但如果是疾病的診斷和治療方法，這種是不能申請專利的。
具體到如何申報專利，可以聘請專利代理機構撰寫專利申請文件，並向國家知識產權遞交申請文件，經國家知識產權審核符合專利權授予的條件，則可以獲得專利權。
祖傳秘方申報專利的流程如下：
1、秘方所有權人應當提交請求書、說明書及其摘要和權利要求書等文件；
2、國務院專利行政部門收到發明專利申請後，進行壹年半的初步審查和三年的實質審查；
3、通過審查的，發給發明專利證書
普通專利申請應由申請人向國家專利機關提出申請，經國家專利機關批準並頒發證書。申請人在向國家專利機關提出專利申請時，還應提交壹系列的申請文件，如請求書、說明書、摘要和權利要求書等等。申請專利時應滿足以下條件：
1、新穎性，是指該發明或者實用新型不屬於現有技術;也沒有任何單位或者個人就同樣的發明或者實用新型在申請日以前向國務院專利行政部門提出過申請，並記載在申請日以後公布的專利申請文件或者公告的專利文件中。
2、創造性，是指與現有技術相比，該發明具有突出的實質性特點和顯著的進步，該實用新型具有實質性特點和進步。
3、實用性，是指該發明或者實用新型能夠制造或者使用，並且能夠產生積極效果。本法所稱現有技術，是指申請日以前在國內外為公眾所知的技術。
法律依據：
《專利法》第二十六條第壹款申請發明或者實用新型專利的，應當提交請求書、說明書及其摘要和權利要求書等文件
第三十四條國務院專利行政部門收到發明專利申請後，經初步審查認為符合本法要求的，自申請日起滿十八個月，即行公布
國務院專利行政部門可以根據申請人的請求早日公布其申請
第三十五條第壹款發明專利申請自申請日起三年內，國務院專利行政部門可以根據申請人隨時提出的請求，對其申請進行實質審查；申請人無正當理由逾期不請求實質審查的，該申請即被視為撤回