98版對86版做了如下改進:①在詞根-符號方面:a . 98版比86版(234個)多了符號(259個)，多方面做了科學合理的調整；因此，相比之下，從漢字中識別和拆分符號更容易，代碼檢索比以前更方便快捷。b .取消了壹些似是而非的“強扭符號”，這是向標準化邁出的壹步。這樣做可以消除用戶對代碼的別扭感，降低代碼的學習難度。②在取碼規則方面:A.98版本比86版本選擇了更多的“重心符號”和“多個符號”，減少了取碼時部分符號的拆分，取碼更加流暢方便；此外，將“筆畫向前”改為“筆畫向後”也可以使代碼檢索更加流暢方便，這也是提高輸入速度的壹個進步。b .改變了部分筆畫取碼順序，使取碼順序與漢字書寫順序壹致，糾正了86版的部分取碼錯誤，也是向規範化邁進了壹步。③在簡碼的編碼排列上:86版吳彼編碼中，有很多重復的簡碼。比如九個漢字“民主要這個”都有壹級和二級簡碼，其中五個漢字“民主要這個”同時有壹級、二級和三級簡碼，兩個漢字“同經”同時有壹級、二級和三級簡碼和四個全碼；600多個有二級簡碼的漢字，幾乎都有三級簡碼。98版改變了這種編碼方式，大大減少了簡碼的重復，從而減少了“編碼位”的浪費，在二、三級排列了更多簡碼漢字，減少了重碼漢字，有利於提高漢字的輸入速度。④在詞組方面，98版比86版有更多更合理的詞組，無疑有利於提高輸入速度。
2.98 86版的弄巧成拙
98版對86版的改進是主要的，但也有弄巧成拙的缺陷，主要表現在“編碼刪除”的問題。什麽是“代碼刪除”？即在吳彼打字軟件98版中，刪除了按編碼規則編制的漢字編碼:比如有二級簡碼的漢字，大部分只能以其二級簡碼的形式輸入，其三級簡碼大部分用其他漢字的“詞組”或三級簡碼排列，部分為“空”(即什麽也不排列)；對於有三級簡碼的漢字，大部分只能以其三級簡碼的形式輸入，只有少數漢字的四級全碼可以排在被刪除的第四碼的位置，而且大部分是“空格”。其出發點是:充分利用編碼位進壹步提高輸入速度；但這樣壹來就失去了漢字編碼在碼級的自由度，使得很多漢字失去了“碼滿自動入稿”的功能