交通工程系下設交通工程教研室和交通運輸教研室，下設“智能交通系統與物流技術研究院”和“國家智能交通技術培訓網-廣州中心”兩個研究機構。專任教師19人，其中教授4人，副教授4人，博士生導師4人，碩士生導師7人，具有博士學位的教師11人。為社會培養了450多名本科畢業生、100名碩士畢業生、30名博士畢業生和50名工程碩士畢業生，具備了從本科到博士多層次人才培養的資格和能力。
交通工程系在交通信息采集與處理、道路交通控制與管理、交通安全與交通環境、交通建模仿真與優化、交通監控技術、智能交通系統、道路收費系統、公路機電設施設計、城市公共交通規劃、道路交通規劃與管理、綜合交通、客運系統、運輸企業管理等研究領域開展了深入的科學研究，取得了壹批具有代表性的創新研究成果。五年來，承擔國家“863計劃”項目、國家自然科學基金、廣東省重大科技重點項目等重大科研項目50余項，獲得科研經費近5000萬元。發表學術論文近300篇，其中90余篇被三大索引收錄；獲省部級獎5項，其中壹等獎1，二等獎3項，三等獎1；獲得發明專利2項，實用新型專利6項；出版教材2部，專著4部；並實現了多項科研成果的轉化。交通工程系壹直緊密結合廣東省交通行業的發展需求，根據廣東省的交通狀況，註重科技研究和創新。研究成果得到了國內同行的高度認可，為華南地區的交通建設和管理做出了積極貢獻。
在科研方面，交通工程系以交通工程、交通信息工程與控制、交通規劃與管理、控制理論與控制工程為依托，以“211”、“985”等高水平大學建設項目為支撐，組建了“交通信息工程與控制”學科團隊，包括“智能交通系統”、“交通規劃”等
在學科建設方面，交通工程系具備交通工程本科、交通信息工程與控制碩士、交通規劃與管理碩士、交通工程領域碩士、交通信息工程與控制博士的培養資質和能力，組建了交通信息工程與控制學科團隊，包括智能交通系統、交通規劃與管理、高速公路信息工程與系統優化與仿真三個學術團隊。是國家“211工程”重點建設學科和國家“985”工程學科平臺，建設了智能交通系統與物流技術研究院、國家智能交通技術培訓網絡廣州中心等研究機構。
智能交通系統與物流技術研究所；
智能交通系統與物流技術研究所成立於2000年。依托交通工程、物流工程、交通信息工程與控制、交通規劃與管理、控制理論與控制工程等學科，組建了智能交通系統和交通規劃與管理兩個研究團隊。是科技部組織的中國its系統框架“十五”研究單位之壹，在國內智能交通領域處於領先水平，部分研究方向達到國際先進水平。
國家智能交通技術培訓網絡-廣州中心
國家智能交通技術培訓網廣州中心是由國家智能交通系統協調指導小組辦公室和交通部公路科學研究院(國家智能交通系統工程技術研究中心)根據國家重點科技項目“智能交通系統社會環境體系建設”委托，在華南地區唯壹的智能交通技術培訓中心。中心總部設在華南理工大學通信學院，擁有雄厚的師資力量和實驗條件。根據培訓對象和內容的需要，中心還邀請交通行業有關部門領導和國內外知名專家學者授課，並組織到發達地區和先進省市實習。