同時應考慮到與已發表的序列不相同或不相似。
如果目前公開了序列，但是妳不知道用途，而妳的發明獲得了用途，也可以申請專利。
幾乎所有在人類基因組中發現的基因都獲得了專利。
所謂的“基因專利”，其實是不準確的。嚴格來說，所謂的“基因專利”應該是指壹個(脫氧)核苷酸序列本身的專利，這個(脫氧)核苷酸序列的功能(用途)的專利，這個(脫氧)核苷酸序列的制備方法的專利，以及在某些情況下，從這個(脫氧)核苷酸序列獲得的氨基酸序列的專利。
進壹步的解釋是，壹個新發現的(脫氧)核苷酸序列(不壹定是基因，比如幹擾RNA)，只要明確了它的功能，就可以為這個(脫氧)核苷酸序列本身和這個(脫氧)核苷酸序列新發現的功能申請專利。如果這個(脫氧)核苷酸序列是通過特殊的制備方法制備的，如高產率，該方法本身也是可用的。當然，如果對壹個已知的(脫氧)核苷酸序列發現了新的功能或更好的制備方法，妳也可以為這個新的功能或制備方法申請專利。需要註意的是，能否申請專利，主要取決於妳是否“發現”了與這個(脫氧)核苷酸序列相關的“新效應”，與這個(脫氧)核苷酸序列與已公布的序列的相似性(同源性)無關。比如，如果只改變壹個已發表基因的壹個堿基，並且表達效率明顯提高，改變的基因可以申請專利，雖然整體序列變化不大；反之，即使妳把壹個已發表的序列的堿基改變了50%以上，它的所有功能都沒有改變，妳仍然不能申請專利。
申請基因和蛋白質專利很復雜。最好委托正規的專利代理人協助辦理，尤其是有現代分子生物學技術背景的專利代理人。