南京理工大學由中國人民解放軍軍事工程學院創建於1953。歷經炮兵工程學院、華東工程學院、華東工程學院等發展階段，於1993更名為南京理工大學。
南京農業大學的前身可以追溯到1902年的三江師範學校和1914年的金陵大學。1952期間，全國高校院系調整，由金陵大學和原國立中央大學農學院以及浙江大學部分院系合並而成南京農學院。1963被確定為全國重點大學。1984更名為南京農業大學。
第二，學校規模不同
截止2019年4月，南京理工大學占地面積3118畝，建築面積108萬平方米。有20個學院和兩個獨立學院。收藏中外文圖書文獻250多萬冊；各類學生30000多人，國際學生1000多人。教職工3200余人，專任教師1.900人。
截至2018年3月，南京農業大學擁有19個學院(系)，62個本科專業，31個壹級學科碩士學位授權點，17個壹級學科博士學位授權點，15個博士後科研流動站，擁有4個壹級學科國家重點學科和3個二級學科。全日制本科生17000多人，研究生8500多人。校園總面積9平方公裏，建築面積74萬平方米，總資產35億元，館藏圖書資料235萬余冊，電子書15萬余冊。
第三，學校的影響不同。
南京理工大學是國家“211工程”和“985工程優勢學科創新平臺”重點建設高校之壹，入選國家“11計劃”、卓越工程師教育培養計劃、建設高水平大學國家公共研究生計劃、新型工程研究與實踐項目、大學生國家創新實驗計劃。
是中國政府來華留學生獎學金接收機構、全國創新創業典型經驗高校、全國首批深化創新創業教育改革示範高校、全國首批高校實踐教育創新創業基地、全國首批高校科技成果轉化和技術轉移基地、全國專利工作試點示範高校。
南京農業大學是國家“雙壹流”、“211工程”、“985工程優勢學科創新平臺”重點建設高校。先後入選111計劃、2011計劃、863計劃、973計劃、國家高水平大學研究生計劃、中國政府來華留學人員獎學金接收機構、國家大學生文化素質教育基地。是“雙壹流”農業聯盟，高水平大學。
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