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啟動子有哪三個堿基

原核表達系統中通常使用的可調控的啟動子

有Lac(乳糖啟動子)、Trp(色氨酸

啟動子)、Tac(乳糖和色氨酸的雜合啟動子) 、lPL (l噬菌體

的左向啟動子)、T7噬菌體啟動子等。

(1)Lac啟動子:它來自大腸桿菌

的乳糖操縱子

,是DNA分子

上壹段有方向的核苷酸序列,由阻遏蛋白基因(LacI)、啟動基因(P)、操縱基因(O)和編碼3個與乳糖利用有關的酶的基因結構所組成。Lac啟動子受分解代謝

系統的正調控和阻遏物的負調控。正調控通過CAP(catabolite gene activation protein)因子和cAMP來激活啟動子,促使轉錄進行。負調控則是由調節基因產生LacZ阻遏蛋白,該阻遏蛋白能與操縱基因結合阻止轉錄。乳糖及某些類似物如IPTG可與阻遏蛋白形成復合物,使其構型改變,不能與O基因結合,從而解除這種阻遏,誘導轉錄發生。

(2)trp啟動子:它來自大腸桿菌的色氨酸操縱子,其阻遏蛋白必須與色氨酸結合才有活性。當缺乏色氨酸時,該啟動子開始轉錄。當色氨酸較豐富時,則停止轉錄。b-吲哚

丙烯酸

可競爭性抑制色氨酸與阻遏蛋白的結合,解除阻遏蛋白的活性,促使trp啟動子轉錄。

(3)Tac啟動子:Tac啟動子是壹組由Lac和trp啟動子人工構建的雜合啟動子,受Lac阻遏蛋白的負調節,它的啟動能力比Lac和trp都強。其中Tac 1是由Trp啟動子的-35區加上壹個合成的46 bp DNA片段(包括Pribnow 盒)和Lac操縱基因構成,Tac 12是由Trp的啟動子-35區和Lac啟動子的-10區,加上Lac操縱子中的操縱基因部分和SD序列融合而成。Tac啟動子受IPTG的誘導。

(4)lPL啟動子:它來自l噬菌體早期左向轉錄啟動子,是壹種活性比Trp啟動子高11倍左右的強啟動子。lPL啟動子受控於溫度敏感的阻遏物 cIts857。在低溫(30℃)時,cIts857阻遏蛋白可阻遏PL啟動子轉錄。在高溫(45℃)時,cIts857蛋白失活,阻遏解除,促使PL啟動子轉錄。系統由於受cIts857作用,尤其適合於表達對大腸桿菌有毒的基因產物,缺點是溫度轉換不僅可誘導PL啟動子,也可誘導熱休克基因,其中有壹些熱休克基因編碼蛋白酶

。如果用l噬菌體cI+溶源菌,並用絲裂黴素C或萘啶酮酸進行誘導,可緩解這壹矛盾。

(5)T7噬菌體啟動子:它是來自T7噬菌體的啟動子,具有高度的特異性

,只有T7RNA聚合酶

才能使其啟動,故可以使克隆化基因獨自得到表達。T7RNA聚合酶的效率比大腸桿菌 RNA聚合酶高5倍左右,它能使質粒沿模板連續轉錄幾周,許多外源終止子

都不能有效地終止它的序列,因此它可轉錄某些不能被大腸桿菌RNA聚合酶有效轉錄的序列。這個系統可以高效表達其他系統不能有效表達的基因。但要註意用這種啟動子時宿主中必須含有T7RNA聚合酶。應用T7噬菌體表達系統需要2個條件:第壹是具有T7噬菌體RNA聚合酶,它可以由感染的l噬菌體或由插入大腸桿菌染色體上的壹個基因拷貝產生;第二是在壹個待表達基因上遊帶有T7噬菌體啟動子的載體。

回答於 2011-12-09

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真核生物上遊啟動子元件包括哪些

真核生物啟動子有三類,分別由RNA聚合酶Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ進行轉錄。 類別Ⅰ(class Ⅰ)啟動子: 只控制rRNA前體基因的轉錄,轉錄產物經切割和加工後生成各種成熟rRNA。 類別Ⅰ啟動子由兩部分保守序列組成: 核心啟動子(core promoter):位於轉錄起點附近,從-45至+20; 上遊控制元件(upstream control element,UCE):位於-180至-107; RNA聚合酶Ⅰ對其轉錄需要2種因子參與: UBF1:壹條M為97000的多肽鏈,結合在上述兩部分的富含GC區; 1個TBP,即TATA結合蛋白(TATA-binding protein,TBP); SL1:壹個四聚體蛋白,含有 3個不同的轉錄輔助因子TAFⅠ; 在SL1因子介導下RNA聚合酶Ⅰ結合在轉錄起點上並開始轉錄。類別Ⅱ(class Ⅱ)啟動子: 類別Ⅱ啟動子涉及眾多編碼蛋白質的基因表達的控制。 該類啟動子包含4類控制元件: 1基本啟動子(basal promoter):序列為中心在-25至-30左右的7 bp保守區,TATAAAA/T, 稱為TATA框或Goldberg-Hogness 框。與RNA聚合酶的定位有關,DNA雙鏈在此解開並決定轉錄的起點位置。失去TATA框,轉錄將在許多位點上開始。 2起始子(initiator):轉錄起點位置處的壹保守序列,***有序列為:PyPyANT(A)PyPy Py為嘧啶堿(C或T),N為任意堿基,A為轉錄的起點。DNA在此解開並起始轉錄。 3上遊元件(upstream factor):普遍存在的上遊元件有CAAT框、GC框和八聚體(octamer) 框等。CAAT框的***有序列是GCCAATCT,GC框的***有序列為GGGCGG和CCGCCC,八聚體框含有8bp,***有序列為ATGCAAAT; 4應答元件(response element):誘導調節產生的轉錄激活因子與靶基因上的應答元件結合。 如熱休克效應元件 HSE 的***有序列是 CNNGAANNTCCNNG,可被熱休克因子HSF識別和作用;血清效應元件SRE的***有序列CCATATTAGG,可被血清效應因子SRF識別和作用。參與RNA聚合酶Ⅱ轉錄起始的各類因子數目很大,可分為3類: 1通用因子(general factor):作用於基本啟動子上的輔助因子稱為通用(轉錄)因子(GTF), 或基本轉錄因子(basal transcription),為任何細胞類別Ⅱ啟動子起始轉錄所必需,以TFⅡⅩ來表示,其中Ⅹ按發現先後次序用英文字母定名,如TFⅡA、TFⅡD、TFⅡH。 2上遊因子(upstream factor):或轉錄輔助因子(transcription ancillary factor),是指識別上 遊元件的轉錄因子。 3可誘導因子(inducible factor):在真核生物中,與細胞類型和發育階段相關的基因表達, 主要通過轉錄因子的重新合成來進行調節的,是長期的過程。對外界刺激的快速反應則主要通過轉錄激活物(transcription activator)的可誘導調節。這些誘導的轉錄激活因子與靶基因上所謂應答元件相結合。類別Ⅲ(class Ⅲ)啟動子: 類別Ⅲ啟動子為RNA聚合酶Ⅲ所識別,他涉及壹些小分子RNA的轉錄。 RNA聚合酶Ⅲ的啟動子有3種類型結構:1類型1基因內啟動子:如5S rRNA基因的啟動子,位於轉錄起點下遊,即在基因內部,是 下遊啟動子,有兩個框架序列,被3種輔助因子所識別。5S rRNA基因的啟動子包括框架A(box A)、中間元件(intermediate element)和框架C(box C)3個元件組成。TFⅢA結合在框架A上,然後促使TFⅢC結合,後者結合導致TFⅢB結合到轉錄起點附近,並引導RNA聚合酶Ⅲ結合在起點上。TFⅢB使RNA聚合酶Ⅲ正確定位,起“定位因子”(positioning factor)作用。 2類型2基因內啟動子:如tRNA基因的啟動子,有兩個控制元件,分別為框架A和框架B。 TFⅢC結合框架B,其結合區域包括框架A和框架B,然後導致TFⅢB結合到轉錄起點附近,並引導RNA聚合酶Ⅲ結合在起點上。 3上遊啟動子:如snRNA基因的啟動子,位於轉錄起點上遊。有3個上遊元件:OCT(八 聚體基序 octamer motif)、PSE(鄰近序列元件 proximal sequence element)、TATA元件。在RNA聚合酶Ⅲ的上遊啟動子中,只有靠近起點存在TATA元件,就能起始轉錄。然而PSE和OCT元件的存在將會增加轉錄效率。

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細菌的啟動子有哪些

細菌的啟動子包含幾個分散的序列,-35區,擴展的-10區,-10區,σ因子的識別區和由α亞基的羧基末端結構域識別的UP元件。所有的細菌都具有壹個必需σ因子,稱為管家σ因子(例如大腸桿菌中的σ70;也被稱作RpoD ),它負責識別大多數啟動子(圖1b)。管家σ因子由4個結構域組成,這些結構域通過柔性linkers連接。在RNA聚合酶全酶中,σ因子結合在核心酶的亞基上,使得σ因子的每個結構域都與特定的啟動子元件相互作用。σ因子的結構域3和4主要作用是RNA聚合酶的最初定位,結構域1和2主要作用是促進開放復合物的形成。管家σ因子的另壹個作用是通過結構域1調節的,它能確保DNA在RNA與啟動子結合之前不進入活性區域,當RNA聚合酶與啟動子結合後觸發構象的改變允許DNA進入活性區域。擴展資料啟動子功能變異的疾病:以下是從人類孟德爾遺傳學(OMIM)證實與啟動子故障有關,不論是因啟動子序列直接突變或是轉錄因子或轉錄***激發因子的突變。而多種癌癥都沒有列下是因為從染色體易位產生嵌合基因:哮喘 β地中海貧血、魯賓斯坦泰比綜合癥。要留意的是在病原學上大部份的疾病都是異質的,而在分子層面上壹種疾病往往是指多種疾病,縱然它們的病征及治療方法壹致。疾病對治療有不同的反應,是因背後分子源頭的差異,這會是藥物遺傳學的範疇。百度百科-啟動子

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(1)Lac啟動子:它來自大腸桿菌

的乳糖操縱子

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