現在單就歷史來說
早在公元前壹世紀，人們就已發現通過球形透明物體去觀察微小物體時，可以使其放大成像。後來逐漸對球形玻璃表面能使物體放大成像的規律有了認識。
1590年，荷蘭和意大利的眼鏡制造者已經造出類似顯微鏡的放大儀器。
1611年，Kepler(克蔔勒)：提議復合式顯微鏡的制作方式。
1665年，Hooke(虎克)：「細胞」名詞的由來便由虎克利用復合式顯微鏡觀察軟木的木栓組織上的微小氣孔而得來的。
1674年，Leeuwenhoek(列文虎克)：發現原生動物學的報導問世，並於九年後成為首位發現「細菌」存在的人。
1833年，Brown(布朗)：在顯微鏡下觀察紫羅蘭，隨後發表他對細胞核的詳細論述。
1838年，Schlieden and Schwann(施萊登和施旺)：皆提倡細胞學原理，其主旨即為「有核細胞是所有動植物的組織及功能之基本元素」。
1857年，Kolliker(寇利克)：發現肌肉細胞中之線粒體。
1876年，Abbe(阿比)：剖析影像在顯微鏡中成像時所產生的繞射作用，試圖設計出最理想的顯微鏡。
1879年，Flrmming(佛萊明)：發現了當動物細胞在進行有絲分裂時，其染色體的活動是清晰可見的。
1881年，Retziue(芮祖)：動物組織報告問世，此項發表在當世尚無人能淩駕逾越。然而在20年後，卻有以Cajal(卡嘉爾)為首的壹群組織學家發展出顯微鏡染色觀察法，此舉為日後的顯微解剖學立下了基礎。
1882年，Koch(寇克)：利用苯安染料將微生物組織進行染色，由此他發現了霍亂及結核桿菌。往後20年間，其它的細菌學家，像是Klebs 和 Pasteur(克萊柏和帕斯特)則是藉由顯微鏡下檢視染色藥品而證實許多疾病的病因。
1886年，Zeiss(蔡氏)：打破壹般可見光理論上的極限，他的發明--阿比式及其它壹系列的鏡頭為顯微學者另辟壹新的解像天地。
1898年，Golgi(高爾基)：首位發現細菌中高爾基體的顯微學家。他將細胞用硝酸銀染色而成就了人類細胞研究上的壹大步。
1924年，Lacassagne(蘭卡辛)：與其實驗工作夥伴***同發展出放射線照相法，這項發明便是利用放射性釙元素來探查生物標本。
1930年，Lebedeff(萊比戴衛)：設計並搭配第壹架幹涉顯微鏡。另外由Zernicke(卓尼柯)在1932年發明出相位差顯微鏡，兩人將傳統光學顯微鏡延伸發展出來的相位差觀察使生物學家得以觀察染色活細胞上的種種細節。
1941年，Coons(昆氏)：將抗體加上螢光染劑用以偵測細胞抗原。
1952年，Nomarski(諾馬斯基)：發明幹涉相位差光學系統。此項發明不僅享有專利權並以發明者本人命名之。
1981年，Allen and Inoue(艾倫及艾紐)：將光學顯微原理上的影像增強對比，發展趨於完美境界。
1988年，Confocal(***軛焦)掃描顯微鏡在市場上被廣為使用。
激光***聚焦顯微鏡
激光掃描***聚焦顯微鏡是二十世紀80年代發展起來的壹項具有劃時代的高科技產品，它是在熒光顯微鏡成像基礎上加裝了激光掃描裝置，利用計算機進行圖像處理，把光學成像的分辨率提高了30%--40%，使用紫外或可見光激發熒光探針，從而得到細胞或組織內部微細結構的熒光圖像，在亞細胞水平上觀察諸如Ca2+ 、PH值，膜電位等生理信號及細胞形態的變化，成為形態學，分子生物學，神經科學，藥理學，遺傳學等領域中新壹代強有力的研究工具。激光***聚焦成像系統能夠用於觀察各種染色、非染色和熒光標記的組織和細胞等，觀察研究組織切片，細胞活體的生長發育特征，研究測定細胞內物質運輸和能量轉換。能夠進行活體細胞中離子和PH值變化研究（RATIO），神經遞質研究，微分幹涉及熒光的斷層掃描，多重熒光的斷層掃描及重疊，熒光光譜分析熒光各項指標定量分析熒光樣品的時間延遲掃描及動態構件組織與細胞的三維動態結構構件，熒光***振能量的轉移的分析，熒光原位雜交研究（FISH），細胞骨架研究，基因定位研究，原位實時PCR產物分析，熒光漂白恢復研究（FRAP），胞間通訊研究，蛋白質間研究，膜電位與膜流動性等研究，完成圖像分析和三維重建等分析。
***聚焦顯微鏡已經在醫學領域廣泛應用，分類如下：A.在細胞及分子生物學中的應用 ⒈ ；細胞、組織的三維觀察和定量測量
⒉ ；活細胞生理信號的動態監測
⒊ ；粘附細胞的分選
⒋ ；細胞激光顯微外科和光陷阱功能
⒌ ；光漂白後的熒光恢復
⒍ ；在細胞雕亡研究中的應用B.在神經科學中的應用 ⒈ ；定量熒光測定
⒉ ；細胞內離子的測定
⒊ ；神經細胞的形態觀察C.在耳鼻喉科學中的應用 ⒈ ；在內耳毛細胞亞細胞結構研究上的應用
⒉ ；激光掃描***聚焦顯微鏡的熒光測鈣技術在內耳毛細胞研究中的應用
⒊ ；激光掃描***聚焦顯微鏡在內耳毛細胞離子通道研究上的應用
⒋ ；激光掃描***聚焦顯微鏡在嗅覺研究中的應用D.在腫瘤研究中的應用 ⒈ 定量免疫熒光測定
⒉ 細胞內離子分析
⒊ 圖像分析：腫瘤細胞的二維圖像分析
⒋ 三維重建E.在內分泌領域的應用 ⒈ 細胞內鈣離子的測定
⒉ 免疫熒光定位及免疫細胞化學研究
⒊ 細胞形態學研究：利用激光掃描***聚焦顯微鏡F.在血液病研究中的應用 ⒈ 在血細胞形態及功能研究方面的應用
⒉ 在細胞雕亡研究中的應用G.在眼科研究中的應用 ⒈ 利用激光掃描***聚焦顯微鏡觀察組織、細胞結構
⒉ 集合特殊的熒光染色在活體上觀察角膜外傷修復中細胞移行及成纖維細胞的出現
⒊ 利用激光掃描***聚焦顯微鏡觀察視網膜中視神經細胞的分布以及神經原的樹枝狀形態
⒋ 三維重建H. 在腎臟病中的應用 可以系統觀察正常人腎小球系膜細胞的斷層掃描影像及三維立體影像水平，使圖像更加清晰，從計算機分析系統可從外觀到內在結構，從平面到立體，從靜態到動態，從形態到功能幾個方面對系膜細胞的認識得到提高。
SIM超分辨率顯微鏡，STEP透射電子顯微鏡。。資料太多，百度知道協議又老怪怪的，沒事亂刪，寫多了，都不知能不能發，不能發，妳就收不到，也沒用。